119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0686 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  98.55 
 
 
693 aa  1190    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  100 
 
 
692 aa  1296    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  57.74 
 
 
1562 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  62.25 
 
 
620 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  62.07 
 
 
630 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  44.56 
 
 
523 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  47.15 
 
 
522 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  46.85 
 
 
514 aa  235  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  46.55 
 
 
516 aa  230  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  42.89 
 
 
523 aa  224  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  48.14 
 
 
888 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  47.97 
 
 
892 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  50 
 
 
737 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  47.97 
 
 
888 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  40.05 
 
 
536 aa  206  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  47.55 
 
 
537 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  46.55 
 
 
886 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  46.18 
 
 
886 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  49.43 
 
 
528 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  52.2 
 
 
397 aa  177  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  48.58 
 
 
399 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  48.5 
 
 
399 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  51.67 
 
 
405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  55.25 
 
 
405 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  55.25 
 
 
405 aa  173  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  47.69 
 
 
375 aa  172  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  50.29 
 
 
420 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  41.18 
 
 
572 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  48.58 
 
 
399 aa  170  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  52.08 
 
 
405 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  48.31 
 
 
432 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  51.56 
 
 
405 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  41.37 
 
 
578 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  50.75 
 
 
400 aa  164  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  40.22 
 
 
393 aa  154  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  45.59 
 
 
735 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  55.56 
 
 
746 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  57.26 
 
 
762 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  54.84 
 
 
753 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  46.99 
 
 
272 aa  124  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  45.51 
 
 
275 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  45.45 
 
 
272 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  40.51 
 
 
300 aa  119  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  42.05 
 
 
272 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  43.18 
 
 
272 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  43.5 
 
 
272 aa  114  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  41.44 
 
 
275 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  42.54 
 
 
272 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  37.43 
 
 
289 aa  99.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  33.9 
 
 
547 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  35.15 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  34.83 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  32.73 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  34.19 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  35.15 
 
 
272 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  32.98 
 
 
320 aa  66.6  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  31.91 
 
 
320 aa  64.7  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  31.91 
 
 
320 aa  64.3  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  30.85 
 
 
320 aa  61.6  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
395 aa  60.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  33.7 
 
 
395 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  31.82 
 
 
321 aa  60.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  29.85 
 
 
475 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  30.77 
 
 
395 aa  59.3  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  31.91 
 
 
585 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  27.91 
 
 
279 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  31.91 
 
 
320 aa  58.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  29.67 
 
 
475 aa  58.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  40 
 
 
289 aa  57.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  31.87 
 
 
302 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  30.77 
 
 
302 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  32.26 
 
 
321 aa  55.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  27.53 
 
 
282 aa  54.3  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  29.52 
 
 
275 aa  54.3  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  32.26 
 
 
389 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  28.77 
 
 
292 aa  52.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  30.77 
 
 
302 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  26.35 
 
 
274 aa  52.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  31.87 
 
 
380 aa  52.4  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  27.22 
 
 
277 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  29.67 
 
 
592 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  26.95 
 
 
274 aa  52  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  25.46 
 
 
518 aa  52  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  29.67 
 
 
301 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  45.16 
 
 
587 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  34.72 
 
 
311 aa  50.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  28.57 
 
 
590 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  36.11 
 
 
389 aa  50.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  27.37 
 
 
282 aa  50.8  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1338  flagellin  24.76 
 
 
576 aa  50.8  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  25.49 
 
 
488 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  32.97 
 
 
292 aa  50.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  29.79 
 
 
439 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  32.88 
 
 
282 aa  50.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  28.57 
 
 
302 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  29.67 
 
 
303 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  26.96 
 
 
462 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  24.12 
 
 
281 aa  49.3  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  29.67 
 
 
303 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  28.72 
 
 
494 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>