More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1602 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1602  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 304 aa  628  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1235  farnesyl-diphosphate synthase  39.06 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  39.48 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  37.75 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  38.35 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  38.03 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  38.55 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  39.93 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  37.86 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  39.68 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  39.19 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  34.42 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  37.86 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  38.62 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  35.19 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  39.55 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  42.53 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  38.89 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0754  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.48 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000103665  hitchhiker  0.0000280825 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  34.24 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  35.39 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0274  geranyltranstransferase  40.17 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  35.53 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  35.25 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  41.98 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  39.66 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  34.43 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  35.04 
 
 		 300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  34.53 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  33.78 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  38.27 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  34.53 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  36.93 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  32.59 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  33.21 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  35.04 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  35.92 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  32.07 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  35.9 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  34.67 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  34.38 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  38.17 
 
 		 297 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  35.04 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  33.1 
 
 		 290 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  34.78 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  35.04 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  41.23 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0337  polyprenyl synthetase  37.96 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  43.1 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  32.15 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  36.06 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1736  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase; FPP synthase)  36.68 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  37.99 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  42.79 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  37.55 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  31.85 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  39.24 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  35.98 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  40.28 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  39 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  33.98 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  36.03 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  40.28 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  35.61 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  38.17 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  32.75 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  43.72 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  43.72 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  35.1 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  37.35 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  32.95 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  35 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0620  Polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  42.18 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1816  geranyltranstransferase  38.89 
 
 		 281 aa  133  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  41.4 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  34.76 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  35.34 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  40 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  38.57 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.02 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1635  geranyltranstransferase  37.69 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  36.25 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  38.32 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  37.8 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  36.05 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  38.49 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  31.58 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0567  farnesyl-diphosphate synthase  35.1 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  34.93 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1388  polyprenyl synthetase  34.85 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  39.81 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>