More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2517 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  60.12 
 
 		 659 aa  793    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 656 aa  1345    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  59.76 
 
 		 647 aa  793    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  46.21 
 
 		 668 aa  611  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  44.83 
 
 		 648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  46.03 
 
 		 649 aa  570  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  46.91 
 
 		 619 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  46.05 
 
 		 626 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  46.05 
 
 		 626 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  45.69 
 
 		 647 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  45.59 
 
 		 647 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  45.52 
 
 		 647 aa  555  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  45.81 
 
 		 644 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  41.85 
 
 		 669 aa  547  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  43.6 
 
 		 645 aa  545  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  43.47 
 
 		 630 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  42.28 
 
 		 630 aa  455  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  36.3 
 
 		 665 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  36.02 
 
 		 680 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  34.42 
 
 		 674 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 		 674 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  55.71 
 
 		 647 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  36.83 
 
 		 639 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  37.11 
 
 		 603 aa  395  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  55.71 
 
 		 647 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  37.09 
 
 		 631 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.45 
 
 		 622 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  35.57 
 
 		 640 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  35.89 
 
 		 644 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  35.29 
 
 		 612 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  36.35 
 
 		 620 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  34.18 
 
 		 647 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  35.1 
 
 		 605 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.04 
 
 		 628 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  36.28 
 
 		 585 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  34.25 
 
 		 692 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.3 
 
 		 647 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.89 
 
 		 632 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  32.95 
 
 		 695 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.79 
 
 		 606 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  34.79 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 602 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  34.53 
 
 		 612 aa  356  8.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  33.64 
 
 		 605 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  34.02 
 
 		 622 aa  351  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 		 599 aa  350  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  33.69 
 
 		 605 aa  349  8e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 621 aa  347  5e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.94 
 
 		 614 aa  347  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  34.36 
 
 		 620 aa  339  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  31.77 
 
 		 608 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 605 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  32.62 
 
 		 600 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  34.36 
 
 		 643 aa  337  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  33.75 
 
 		 560 aa  336  7e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  32.5 
 
 		 603 aa  336  7e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  34.04 
 
 		 641 aa  336  7.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  33.85 
 
 		 641 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 632 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  33.95 
 
 		 644 aa  334  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  33.74 
 
 		 616 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  34.67 
 
 		 616 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  33.08 
 
 		 626 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  32.52 
 
 		 600 aa  329  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  31.9 
 
 		 641 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 612 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  31.47 
 
 		 608 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 630 aa  324  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  31.27 
 
 		 670 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 606 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 		 625 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  32.62 
 
 		 599 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.72 
 
 		 624 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  34.03 
 
 		 671 aa  321  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 595 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  32.57 
 
 		 597 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  49.69 
 
 		 755 aa  319  9e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  32.4 
 
 		 584 aa  319  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  32.88 
 
 		 687 aa  318  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  32.72 
 
 		 645 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  33.38 
 
 		 615 aa  317  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32.47 
 
 		 626 aa  317  6e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  34.1 
 
 		 623 aa  317  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  31.71 
 
 		 629 aa  316  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  30.64 
 
 		 607 aa  316  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  32.09 
 
 		 635 aa  316  8e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  30.64 
 
 		 607 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  32.93 
 
 		 629 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  32.63 
 
 		 661 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  31.84 
 
 		 630 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  32.77 
 
 		 624 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 648 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 		 647 aa  313  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  32.45 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  31.69 
 
 		 632 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.54 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 		 611 aa  311  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  31.6 
 
 		 632 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  32.1 
 
 		 633 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>