More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  100 
 
 		 311 aa  608  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  61.62 
 
 		 296 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  58.25 
 
 		 291 aa  325  5e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  60.86 
 
 		 307 aa  324  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  61.19 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  59.29 
 
 		 291 aa  318  6e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  57.69 
 
 		 288 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  59.03 
 
 		 313 aa  309  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  61.05 
 
 		 285 aa  308  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  58.19 
 
 		 287 aa  306  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  59.93 
 
 		 581 aa  295  8e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  52.73 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  56.34 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  59.18 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  56.49 
 
 		 347 aa  291  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  56.8 
 
 		 315 aa  285  9e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  52.98 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  58.84 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  54.09 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  58.53 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  58.87 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  55.24 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  54.65 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  54.65 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  54.65 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  51.42 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  53.57 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  57.24 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  51.24 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  53.09 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  54.29 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  51.77 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  49.33 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  52.94 
 
 		 290 aa  255  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  53.33 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  51.47 
 
 		 291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  43.25 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  42.71 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  46.25 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  43.7 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  44.36 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  44.98 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  43.98 
 
 		 360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  39.92 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.41 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1337  HhH-GPD family protein  39.93 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  42.04 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  36.9 
 
 		 388 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  40.08 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  39.92 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.59 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  38.71 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  40.34 
 
 		 396 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  42.99 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  41.51 
 
 		 253 aa  146  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.58 
 
 		 344 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  41.09 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  40.15 
 
 		 365 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  38.23 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  43.14 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  42.62 
 
 		 434 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  40.71 
 
 		 383 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  34.23 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  40.37 
 
 		 358 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.38 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  38.39 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  40.37 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.79 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  38.16 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 368 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 368 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.56 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 368 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 368 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43811  predicted protein  39.01 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  33.8 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 615 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  35.17 
 
 		 344 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  38.73 
 
 		 388 aa  142  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  34.59 
 
 		 364 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  40.78 
 
 		 355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.45 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  38.35 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  35.42 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.47 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  39.51 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  41.45 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.72 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  33.49 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  33.49 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  35.68 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1141  A/G-specific adenine glycosylase  43.38 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  36.24 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>