More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2733 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2733  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 262 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  60.94 
 
 		 261 aa  311  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  57.48 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  57.48 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  55.51 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  55.29 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  53.05 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  55.29 
 
 		 260 aa  265  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  50.97 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.15 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  56.47 
 
 		 259 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  50.78 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  54.94 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6404  short chain dehydrogenase  53.94 
 
 		 259 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.327689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  52.76 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  53.54 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0740  short chain dehydrogenase  54.51 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2029  short chain dehydrogenase  54.51 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  53.31 
 
 		 263 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0368  short chain dehydrogenase  53.36 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4622  short chain dehydrogenase  56.49 
 
 		 258 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2190  short chain dehydrogenase  42.46 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 		 176 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31260  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  35.34 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.974628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  36.22 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.36 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  32.43 
 
 		 240 aa  125  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0252898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.71 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3470  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.698077  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.43 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.43 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5486  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6772  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  33.2 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.628756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  33.72 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6360  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  33.83 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.02 
 
 		 240 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  32.2 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  33.2 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7178  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0959368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  32.82 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3418  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  36.05 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.82 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  33.2 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1817  short chain dehydrogenase  30.19 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  32.8 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  32.8 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8757  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215149  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  31.05 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60133 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.3 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.451543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>