More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1306 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1101  glycogen debranching enzyme GlgX  54.02 
 
 		 738 aa  660    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429589  hitchhiker  0.00127607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  53.25 
 
 		 771 aa  670    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1345  glycogen debranching enzyme GlgX  56.69 
 
 		 756 aa  705    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1306  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 720 aa  1427    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.348446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1726  glycogen debranching enzyme GlgX  51.91 
 
 		 748 aa  664    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10400  glycogen debranching enzyme GlgX  46.96 
 
 		 822 aa  611  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  48.24 
 
 		 700 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  48.29 
 
 		 706 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  47.04 
 
 		 707 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  47.09 
 
 		 720 aa  591  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  46.11 
 
 		 717 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  45.97 
 
 		 717 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  49.05 
 
 		 712 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  45.97 
 
 		 717 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  45.47 
 
 		 717 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  45.72 
 
 		 704 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  47.34 
 
 		 716 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  50 
 
 		 718 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  45.1 
 
 		 727 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  45.23 
 
 		 719 aa  581  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  51.41 
 
 		 709 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  45.36 
 
 		 755 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  46.32 
 
 		 712 aa  580  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  45.41 
 
 		 727 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  47.02 
 
 		 716 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0857  glycogen debranching enzyme GlgX  47.39 
 
 		 703 aa  578  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  46.09 
 
 		 738 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  48.15 
 
 		 712 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  45.49 
 
 		 721 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  47.69 
 
 		 830 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  44.59 
 
 		 701 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  46.75 
 
 		 720 aa  575  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  47.16 
 
 		 802 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  48.01 
 
 		 712 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  45.26 
 
 		 758 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  46.06 
 
 		 701 aa  569  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  47.42 
 
 		 720 aa  569  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  45.26 
 
 		 758 aa  568  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  45.94 
 
 		 738 aa  568  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  45.51 
 
 		 708 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  44.89 
 
 		 720 aa  567  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  48.02 
 
 		 708 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  49.63 
 
 		 711 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  47.71 
 
 		 703 aa  567  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  46.64 
 
 		 720 aa  565  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  48.57 
 
 		 708 aa  568  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  46.42 
 
 		 704 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  45.07 
 
 		 710 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  46.47 
 
 		 701 aa  564  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  47.86 
 
 		 705 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  44.67 
 
 		 751 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  47.86 
 
 		 705 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  47.01 
 
 		 757 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  44.02 
 
 		 713 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  46.8 
 
 		 729 aa  559  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  45.81 
 
 		 730 aa  561  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  47.71 
 
 		 705 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  47.01 
 
 		 779 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  43.75 
 
 		 710 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  46.23 
 
 		 755 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  43.61 
 
 		 718 aa  555  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  44.74 
 
 		 708 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  46.05 
 
 		 723 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  43.59 
 
 		 756 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  48.31 
 
 		 711 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  48.39 
 
 		 704 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  44.55 
 
 		 701 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  44.09 
 
 		 688 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  44.62 
 
 		 704 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  46.13 
 
 		 739 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  44.41 
 
 		 745 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  44.87 
 
 		 716 aa  549  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  48.02 
 
 		 673 aa  549  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5593  glycogen debranching enzyme GlgX  48.25 
 
 		 704 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  44.65 
 
 		 709 aa  550  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  46.81 
 
 		 733 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  44.09 
 
 		 723 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  45.27 
 
 		 766 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  43.09 
 
 		 711 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1695  pullulanase-like glycosidase  45.77 
 
 		 846 aa  545  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.195322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  44.02 
 
 		 701 aa  548  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  42.64 
 
 		 733 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  43.23 
 
 		 711 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  43.75 
 
 		 714 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  45.27 
 
 		 766 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  46.19 
 
 		 704 aa  544  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  45.83 
 
 		 739 aa  545  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  43.61 
 
 		 714 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  42.33 
 
 		 707 aa  542  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  46.6 
 
 		 708 aa  543  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  43.61 
 
 		 714 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  42.24 
 
 		 752 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  44.08 
 
 		 779 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  44.55 
 
 		 706 aa  541  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  44.61 
 
 		 721 aa  539  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  43.6 
 
 		 721 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  44.71 
 
 		 719 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  43.29 
 
 		 728 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  47.28 
 
 		 703 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  42.52 
 
 		 715 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>