More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1856 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  100 
 
 
243 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  57.61 
 
 
246 aa  281  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  50.41 
 
 
250 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  48.76 
 
 
242 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  47.7 
 
 
260 aa  224  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  47.11 
 
 
243 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  49.17 
 
 
244 aa  215  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  46.67 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  44.86 
 
 
260 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  47.52 
 
 
243 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  44.63 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  41.98 
 
 
244 aa  188  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  42.62 
 
 
245 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  45.45 
 
 
243 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  41 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  43.82 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  39.77 
 
 
233 aa  99  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  33.5 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 
232 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  38.41 
 
 
247 aa  89  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  33.78 
 
 
243 aa  89  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  30.2 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  34.38 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  29.41 
 
 
241 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  28.86 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  36.21 
 
 
247 aa  85.5  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  30.09 
 
 
244 aa  85.1  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  31.55 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  33.72 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  30.97 
 
 
507 aa  79.7  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  30.62 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  28.75 
 
 
511 aa  76.6  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  31.9 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  36.81 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  32.24 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  31.9 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  32.46 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  31.95 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  36.31 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  28.96 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  31.84 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  33.91 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  31.21 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  31.55 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  36.07 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  31.55 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  31.48 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  30.85 
 
 
529 aa  70.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.23 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  32.02 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  28.17 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  35.03 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  27.41 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  32.24 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  30 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.23 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  37.14 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  32.24 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  32.89 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  29.29 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  36.99 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  30.43 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  31.58 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  32.47 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  32.79 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  32.67 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  28.27 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  32 
 
 
520 aa  66.2  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  31.97 
 
 
517 aa  66.2  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.72 
 
 
536 aa  66.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  35.62 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  31.69 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  33.56 
 
 
513 aa  65.1  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  31.36 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  33.33 
 
 
505 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  34.93 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  32.6 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  26.8 
 
 
512 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  32.46 
 
 
183 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  32.19 
 
 
517 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  30.07 
 
 
512 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  25.39 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  29.26 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  31.25 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  33.78 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  29.38 
 
 
184 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  29.87 
 
 
524 aa  62  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.87 
 
 
530 aa  62  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  35.42 
 
 
535 aa  62  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  28.43 
 
 
510 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  26.13 
 
 
513 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  30.82 
 
 
184 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  25.5 
 
 
531 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>