More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0483 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 237 aa  490  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  57.63 
 
 		 237 aa  284  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  55.74 
 
 		 238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  52.97 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  54.66 
 
 		 242 aa  241  7e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  49.58 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  40.3 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  37.44 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  35.04 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  35.34 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  35.57 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  35.47 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  31.95 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  31.12 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  32.05 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  34.81 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  32.29 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  32.98 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  33.86 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  32.83 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  32.46 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.84 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  35.71 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  33.94 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  30.96 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  35.38 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  29.86 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  28.64 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  29.58 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.15 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  35.9 
 
 		 261 aa  95.1  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  32.08 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  28.99 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  34.98 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  34.98 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 		 288 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  29.82 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  31.41 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  29.87 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  29.5 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  28.3 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  29.61 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  30.43 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  28.09 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  29.72 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  35.06 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  31.79 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  35.06 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  31.72 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  35.06 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  28.63 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  35.06 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 		 389 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  33.01 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  29.61 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  34.54 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  31.16 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  32.99 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  34.42 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.15 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  28.71 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  28.22 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  29.8 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  32.99 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  36.53 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  33.95 
 
 		 947 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  31.16 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  36.13 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  28.51 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  35.95 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  29.46 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  29.59 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  33.85 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  28.03 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  28.05 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  34.38 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>