More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1960 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  57.63 
 
 		 237 aa  284  8e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  56.96 
 
 		 238 aa  274  8e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  50.85 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  52.97 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  47.64 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  38.07 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  36.5 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  34.89 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  33.05 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  35.98 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  32.23 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  31.78 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  31.2 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  32.23 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  33 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  32.35 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  34.92 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  29.74 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.65 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  31.75 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  32.65 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  29.13 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  29.95 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  34.18 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  31.63 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  31.96 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  31.63 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.16 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  32.29 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  28.28 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  29.8 
 
 		 282 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.69 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  30.26 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  28.51 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  30.96 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  29.03 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  29.72 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  34.46 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  26.42 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  28.63 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  29.57 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  30.25 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  33.78 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  32.66 
 
 		 259 aa  89  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  32.31 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  32.12 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.82 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.82 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  29.95 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  30.96 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  33.95 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  36.18 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  28.43 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  33.68 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  30.65 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  30.96 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  32.66 
 
 		 237 aa  85.1  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  32.49 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  31.63 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  30.53 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  29.26 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  29.44 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  30.32 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  35.08 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  26.81 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  29.95 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  32.29 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  32.91 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  30.93 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  34.69 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  29.1 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  32.91 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  32.91 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  32.91 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  28.87 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  32.5 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  29.84 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1030  glutamine amidotransferase class-I  32.97 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0044853  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  32.28 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  29.52 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  34.48 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  31.12 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  28.04 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  30.48 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  27.62 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>