More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2712 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  92.54 
 
 		 228 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  47.35 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  48.48 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  45.65 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  44.25 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  43.61 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  38.6 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  37.27 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  39.43 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  42.59 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  39.78 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  41.71 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  35.56 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  36.27 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  38.71 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  38.71 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  42 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  34.91 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  36.5 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  36.89 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  40.84 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  42.96 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  35.39 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  38.41 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  35.06 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.74 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  34.19 
 
 		 238 aa  114  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  38.17 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  37.75 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  33.73 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  37.63 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  34.91 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  31.78 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  41.5 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  32.24 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  40.53 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  35.5 
 
 		 258 aa  104  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  30.04 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  37.2 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  36.3 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  36.65 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  34.8 
 
 		 947 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  33.86 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  34.33 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  36.88 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  36.21 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  34.05 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  34.59 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  32.83 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  35.2 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  30.9 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  34.11 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  35.64 
 
 		 288 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  36.88 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  43.06 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  38.12 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  33.04 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  34.72 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  32.32 
 
 		 243 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  36.61 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  42.96 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  33.48 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  34.93 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  34.74 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  30.64 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  37.44 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  43.36 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  36.9 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  31.91 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  34.95 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  37.3 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  45.21 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  31.91 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  31.96 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29.18 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  31.07 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  40.13 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  36.49 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  51.49 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  31.03 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  41.98 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  30.33 
 
 		 244 aa  95.1  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 		 250 aa  95.1  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  40.71 
 
 		 241 aa  94.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  40.43 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  33.7 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  41.88 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  39.86 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  41.03 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  32.12 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>