More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3000 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
243 aa  487  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3511  glutamine amidotransferase class-I  78.19 
 
 
243 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175158  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3255  glutamine amidotransferase class-I  65.83 
 
 
240 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3244  glutamine amidotransferase class-I  65.83 
 
 
240 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3306  glutamine amidotransferase class-I  65.83 
 
 
240 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0142588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1094  glutamine amidotransferase class-I  44.1 
 
 
238 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  48.87 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1030  glutamine amidotransferase class-I  41.48 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0044853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3102  glutamine amidotransferase class-I  34.24 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.830668  normal  0.133558 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  31.44 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  40.13 
 
 
228 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  35.18 
 
 
389 aa  95.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  38.92 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  26.91 
 
 
220 aa  93.2  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  34.31 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  32.2 
 
 
229 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  34.95 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  30.63 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  25.22 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  29.13 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  35.58 
 
 
236 aa  85.9  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  31.97 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  26.84 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  30.57 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  28.95 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  28.95 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  33.1 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  36.69 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  37.93 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  31.66 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  37.25 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  29.61 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  30.1 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  30.85 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  27.38 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  30.49 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  34.81 
 
 
234 aa  79  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  37.3 
 
 
241 aa  79  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  28.34 
 
 
237 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  36.96 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  36.23 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  34.04 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  32.8 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  34.05 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  43.24 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  34.04 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  30.81 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  37.32 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  32.26 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  34.48 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  31.77 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  36.31 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  29.7 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  29.7 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  31.71 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  28.7 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  29.7 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  36.62 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  28.27 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  35.37 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  30.93 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  29.19 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  28.35 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  29.95 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  29.15 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  29.65 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  33.96 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  38.19 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  35.29 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  28.5 
 
 
234 aa  72  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  29.57 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  29.85 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  31.28 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  25.82 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  32.61 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  36.02 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  34.97 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  34 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  29.96 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  32.16 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  29.75 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  29.27 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  38.02 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  28.57 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  30.41 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  41.98 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36.43 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  28.22 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  32.2 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>