More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2398 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1030  glutamine amidotransferase class-I  49.12 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0044853  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  48.2 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3255  glutamine amidotransferase class-I  41.71 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3244  glutamine amidotransferase class-I  41.71 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3306  glutamine amidotransferase class-I  41.71 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0142588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3511  glutamine amidotransferase class-I  39.57 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175158  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1094  glutamine amidotransferase class-I  40.46 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  42.2 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  40.44 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  40.09 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  43.29 
 
 		 389 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  39.63 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  29.63 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  34.55 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  38.8 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3102  glutamine amidotransferase class-I  37.1 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.830668  normal  0.133558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  35.81 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  37.76 
 
 		 234 aa  99  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  39.89 
 
 		 236 aa  98.6  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  40.94 
 
 		 237 aa  98.6  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  42.2 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  36.75 
 
 		 230 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 		 234 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  34.23 
 
 		 239 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  35 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  37.37 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  41.21 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  40.33 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  38.19 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  27.91 
 
 		 220 aa  93.2  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  36.26 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  36.19 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.29 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  42.25 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  35.07 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  40.46 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  29.91 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  37.58 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  42.6 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  27.98 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  38.58 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  42.6 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  41.86 
 
 		 236 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  35.32 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  42.51 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  42.6 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  38.06 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  41.01 
 
 		 236 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  41.01 
 
 		 236 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  41.01 
 
 		 236 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  41.01 
 
 		 236 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  41.01 
 
 		 236 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  41.01 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  37.22 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  41.01 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  37.43 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  41.92 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  37.25 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  37.27 
 
 		 238 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  28.33 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  31.28 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  36 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  33.96 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  41.96 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  34.1 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  38.83 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  38.43 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  32.7 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  31.66 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  31.66 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  37.76 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  37.08 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  37.93 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  34.34 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  36.54 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  33.96 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  27.64 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  34.34 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  37.31 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  27.64 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4412  glutamine amidotransferase class-I  49.49 
 
 		 81 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  33.48 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  34.91 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  41.77 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  37.34 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  35.62 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  31.65 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  33.82 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  30 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  34.93 
 
 		 288 aa  78.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  34.36 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  36.6 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  38.05 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>