More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1536 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  100 
 
 
226 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  46.55 
 
 
236 aa  214  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  43.17 
 
 
233 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  43.61 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  40.35 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  39.11 
 
 
231 aa  175  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  39.81 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  37.5 
 
 
229 aa  170  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  38.46 
 
 
230 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  36.56 
 
 
228 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  39.51 
 
 
230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  40.67 
 
 
233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  35.68 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  39.04 
 
 
234 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  39.17 
 
 
244 aa  158  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  38.33 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  46.82 
 
 
184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  38.1 
 
 
251 aa  151  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  32.75 
 
 
243 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  40.65 
 
 
237 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  40.65 
 
 
237 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  34.89 
 
 
241 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  32.16 
 
 
229 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  39.53 
 
 
240 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  39.29 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  40.86 
 
 
237 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  35.35 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  42.11 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  38.25 
 
 
239 aa  128  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  39.13 
 
 
236 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  31.65 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  36.28 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  35.81 
 
 
239 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  35.81 
 
 
239 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  36.21 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  35.35 
 
 
239 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  35.35 
 
 
239 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  40.88 
 
 
234 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  35.52 
 
 
243 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  40.98 
 
 
228 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  40.96 
 
 
231 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  32.24 
 
 
238 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  32.24 
 
 
238 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  32.86 
 
 
238 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  34.02 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  35.8 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  31.92 
 
 
238 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  33.51 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  40.91 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  39.53 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  41.48 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.02 
 
 
254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  37.91 
 
 
232 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  32.89 
 
 
235 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  42.61 
 
 
232 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  37.56 
 
 
235 aa  114  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  36.92 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  29.33 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  35.57 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.38 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  37.43 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  35.68 
 
 
245 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  40.45 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  30.62 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  38.73 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  40.33 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  35.71 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  36.78 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  29.2 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  29.2 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  41.86 
 
 
241 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  35.8 
 
 
236 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  33.16 
 
 
243 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  39.55 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  36.93 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  35.52 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  35.79 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  35.52 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  35.52 
 
 
236 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 
224 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  37.43 
 
 
261 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  36.36 
 
 
237 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
243 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 
236 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  33.01 
 
 
236 aa  108  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  35.52 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  35.16 
 
 
261 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  31.69 
 
 
229 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  35.52 
 
 
236 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 
233 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  37.37 
 
 
252 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  33.16 
 
 
241 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  34.25 
 
 
236 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  34.25 
 
 
236 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  34.25 
 
 
236 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  34.25 
 
 
236 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  34.25 
 
 
236 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>