More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2237 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
233 aa  485  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  51.5 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  52.21 
 
 
233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  48.68 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  48.7 
 
 
229 aa  231  8.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  43.78 
 
 
236 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  44.1 
 
 
231 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  43.17 
 
 
226 aa  202  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  44.05 
 
 
230 aa  201  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  41.41 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  43.61 
 
 
230 aa  198  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  42.92 
 
 
234 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  39.21 
 
 
228 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  39.21 
 
 
228 aa  185  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  43.6 
 
 
243 aa  185  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  39.22 
 
 
238 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  37.71 
 
 
244 aa  169  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  42.86 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  40.34 
 
 
229 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  35.47 
 
 
239 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  43.68 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  39.31 
 
 
184 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  44.83 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  39.49 
 
 
237 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  39.49 
 
 
237 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  43.33 
 
 
236 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 
241 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  44.37 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  37.56 
 
 
234 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  39.05 
 
 
234 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  37.1 
 
 
223 aa  135  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  36.02 
 
 
222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  35.47 
 
 
240 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  36.06 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  41.9 
 
 
233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  42.76 
 
 
236 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  34.62 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  43.06 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  45.89 
 
 
235 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  42.21 
 
 
241 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  37.3 
 
 
237 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  35.47 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  42.11 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  42.11 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  43.45 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  43.07 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  42.76 
 
 
236 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  42.76 
 
 
236 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  42.76 
 
 
236 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  42.76 
 
 
236 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  37.91 
 
 
234 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  42.76 
 
 
236 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 
239 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  42.76 
 
 
236 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  41.38 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  43.07 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  34.74 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  35.83 
 
 
239 aa  128  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  41.78 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  34.62 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  34.62 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  34.05 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  34.05 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  34.62 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  34.62 
 
 
238 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  34.62 
 
 
238 aa  126  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  42.48 
 
 
234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  33.8 
 
 
229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  35.83 
 
 
245 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  39.35 
 
 
237 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  33.19 
 
 
224 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  35.74 
 
 
246 aa  124  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  43.92 
 
 
242 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  43.24 
 
 
232 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  36.68 
 
 
247 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  40.69 
 
 
222 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  37.82 
 
 
237 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 
254 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  36.47 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  39.88 
 
 
233 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  37.21 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  39.6 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  37.43 
 
 
218 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  34.22 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  40.1 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  38.41 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  31.2 
 
 
234 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  38.41 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  42.03 
 
 
246 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  35.96 
 
 
238 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  39.33 
 
 
224 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  42.55 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  32.97 
 
 
243 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  36.78 
 
 
232 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  32.98 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  39.04 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>