More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1005 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
244 aa  501  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  43.39 
 
 
231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  39.67 
 
 
230 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  40.87 
 
 
229 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  41.46 
 
 
236 aa  178  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  40.08 
 
 
229 aa  178  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  44.75 
 
 
238 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  42.98 
 
 
234 aa  171  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  37.71 
 
 
233 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  37.44 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  36.29 
 
 
235 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  39.17 
 
 
226 aa  158  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  36.99 
 
 
243 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  37.44 
 
 
229 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 
233 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  44.92 
 
 
184 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  34.3 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  31.4 
 
 
251 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  32.92 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  42.58 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  42.58 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  32.68 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  35.51 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  37.02 
 
 
223 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.93 
 
 
236 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  41.46 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.74 
 
 
222 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  40.67 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  39.61 
 
 
234 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  30.95 
 
 
245 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  41.24 
 
 
242 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  35.96 
 
 
236 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  39.3 
 
 
213 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  30.56 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  32.11 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  32.94 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  37.74 
 
 
235 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  37.98 
 
 
233 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  39.49 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  31.65 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  36.76 
 
 
234 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  36.06 
 
 
237 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  31.46 
 
 
229 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  33.49 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  33.98 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 
236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  32.58 
 
 
236 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  30.83 
 
 
220 aa  115  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  41.67 
 
 
242 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  32.89 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  32.64 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
227 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
227 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  33.88 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
236 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  32.92 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  34.63 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  32.89 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  36.48 
 
 
232 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  34.57 
 
 
237 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 
236 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  35.5 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  33.03 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  37.69 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  35.12 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  32.58 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  38.19 
 
 
245 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  35.45 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  32.73 
 
 
227 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  31.6 
 
 
252 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  36.04 
 
 
233 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  34.98 
 
 
243 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  39 
 
 
254 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  34.63 
 
 
234 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  35.57 
 
 
218 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  34.53 
 
 
243 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
235 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  32.1 
 
 
239 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  34.17 
 
 
229 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.07 
 
 
247 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 
222 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  34.78 
 
 
238 aa  104  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 
240 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  32.78 
 
 
240 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 
224 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  35.42 
 
 
238 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  36.84 
 
 
237 aa  102  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  39.35 
 
 
231 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  31.09 
 
 
239 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  32.77 
 
 
224 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  31.09 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  30.67 
 
 
239 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  29.76 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>