249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5145 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  39.24 
 
 
236 aa  168  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  38.82 
 
 
237 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  37.66 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  35.98 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  34.47 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  33.91 
 
 
228 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  35.04 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  33.89 
 
 
236 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  32.33 
 
 
389 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  35.47 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  30.13 
 
 
237 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  30.13 
 
 
237 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 
244 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  31.76 
 
 
230 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  31.2 
 
 
231 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  28.57 
 
 
229 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  32.07 
 
 
229 aa  99.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  31.47 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  28.83 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  33.84 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  31.42 
 
 
220 aa  95.5  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.11 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  30.47 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  31.05 
 
 
229 aa  91.7  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  31.3 
 
 
238 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  29.29 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  27.39 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 
233 aa  89  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  32.47 
 
 
226 aa  88.6  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  30.25 
 
 
234 aa  87  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  37.35 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  29.34 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.88 
 
 
233 aa  85.5  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  30.43 
 
 
243 aa  85.5  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  31.15 
 
 
218 aa  85.5  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  28.69 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  30.96 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  28.69 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  30.57 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  36.84 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  29.31 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  28.51 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  27.23 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  26.81 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  32.26 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  29 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  30.17 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  30.67 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  31.15 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  35.2 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  32.97 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  30.26 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  30.88 
 
 
245 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.48 
 
 
229 aa  82  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  29.17 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  35 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  34.59 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  32.02 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  28.5 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  32.43 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  29.41 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  27.5 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  28.36 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3511  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175158  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  29.74 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  28.36 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  30.77 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  32.42 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  30 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  26.47 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  28.33 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  28.93 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  30.04 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  30.77 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  29.1 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  29.29 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  28.99 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  31.5 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1094  glutamine amidotransferase class-I  31.1 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  27.81 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  28.34 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  32.16 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  29.29 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  32.97 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  35.03 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  30.52 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  32.16 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  32.97 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  29.26 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>