259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3027 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
237 aa  490  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  58.4 
 
 
236 aa  278  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  55.27 
 
 
236 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  42.15 
 
 
241 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  37.12 
 
 
389 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  38.82 
 
 
240 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  36.71 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  34.18 
 
 
232 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  34.5 
 
 
228 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  32.92 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  32.92 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  36.21 
 
 
237 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  37.56 
 
 
230 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  33.47 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  29.18 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  35.91 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  33.88 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  37.19 
 
 
238 aa  112  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  33.94 
 
 
229 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  33 
 
 
237 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  35.52 
 
 
236 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  32.29 
 
 
237 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 
231 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  34.29 
 
 
222 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  28.98 
 
 
247 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  35.53 
 
 
229 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  33 
 
 
251 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  32.32 
 
 
237 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  34.58 
 
 
213 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  33.7 
 
 
223 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  31.31 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  33.99 
 
 
209 aa  99.4  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  30.5 
 
 
243 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  29.84 
 
 
220 aa  98.6  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  31.5 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  37.91 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  31.5 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.34 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.62 
 
 
282 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  33.83 
 
 
288 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1030  glutamine amidotransferase class-I  34.46 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0044853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  34.25 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  30.89 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  25.81 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  30.9 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  27.92 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  27.92 
 
 
236 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  27.94 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  27.72 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  32.58 
 
 
243 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  31.88 
 
 
224 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  28.27 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  27.5 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  28.33 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  25.2 
 
 
245 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  28.87 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  32.8 
 
 
222 aa  92  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  34.04 
 
 
245 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  30.69 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  31.13 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  33.51 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  31.18 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  28.69 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  27.5 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  28.69 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  28.69 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  28.69 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  28.69 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  28.69 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  27.08 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  27.1 
 
 
252 aa  89  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  28.44 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  30.99 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  29.11 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  34.3 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  33.86 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  29.52 
 
 
238 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  28.27 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  28.27 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  34.55 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  29.63 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  33.54 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  35.53 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  29.69 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  31.53 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  29.96 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  29.69 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  32.46 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  29.59 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  29.06 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  29.79 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  31.34 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  32.29 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  30.12 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  27.83 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>