More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2798 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  42.55 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  43.78 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  46.91 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  46.55 
 
 		 226 aa  214  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  43.1 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  44.83 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  42.74 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  50.72 
 
 		 238 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  47.03 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  46.81 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  49.23 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  41.75 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  41.46 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  40.17 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  35.22 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  39.47 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  50.56 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  34.47 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  34.04 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  41.63 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  41.63 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  41.12 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  40.35 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  40.61 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  34.67 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  43.06 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  43.75 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  44.89 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  41.95 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  34.89 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  38.31 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  44.08 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  37.67 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  37.21 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  33.05 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  38.89 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  37.33 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  39.39 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  34.6 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  36.57 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  42.13 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  44.06 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  36.74 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  37.88 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  36.7 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  35.9 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  44.91 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  35.82 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  35.82 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  41.21 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  40.57 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  40.7 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  35.18 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  41.15 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  42.35 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.33 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  43.35 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  34.65 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  41.14 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  34.85 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  35.17 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  35.17 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  36.92 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  37.45 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  40.57 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  40.57 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  40.57 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  40.57 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  40.57 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  40.09 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  36.15 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  32.29 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  40.57 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  40 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  34.75 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  42.59 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  34.75 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  29.96 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  41.98 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  34.32 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  38.51 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  44.74 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  41.11 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  41.08 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  42.86 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  32.65 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  43.82 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  41.57 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  29.96 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  29.96 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  43.92 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  41.71 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  37.84 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  40.54 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  40.53 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  32.98 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  41.24 
 
 		 224 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  40.62 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>