282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3185 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  36.71 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  37.92 
 
 
241 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  38.66 
 
 
236 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  34.04 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36.55 
 
 
237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36.55 
 
 
237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  34.76 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  38.24 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  34.67 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  38.61 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 
389 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  35.04 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  37.29 
 
 
231 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  31.51 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  26.72 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  33.82 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  35.24 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 
233 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 
227 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 
227 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  34.29 
 
 
288 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  33.33 
 
 
226 aa  102  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  33.12 
 
 
235 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  33.78 
 
 
234 aa  99  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  33.95 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  29.31 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  30.27 
 
 
233 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  33.7 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  28.78 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  27.8 
 
 
223 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  31.38 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.34 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  31.91 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  38.55 
 
 
257 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 
233 aa  92  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  30.62 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  30.32 
 
 
251 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  32.81 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  28.65 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  25.91 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  32.27 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  29.15 
 
 
242 aa  88.6  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  26.94 
 
 
220 aa  88.6  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  31.76 
 
 
243 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  31.96 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1030  glutamine amidotransferase class-I  32.4 
 
 
224 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0044853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  27.13 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  29.86 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  30.16 
 
 
218 aa  85.9  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  29.03 
 
 
229 aa  85.5  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  32.32 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  36.67 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  32.99 
 
 
233 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  31.49 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  27.83 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  30.3 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  29.47 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  23.93 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  29.69 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  29.24 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  28.98 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  29.23 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  30.05 
 
 
232 aa  82  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  35.8 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  29.65 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  25.47 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  26.67 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  29.17 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  32.16 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  30.64 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  32.11 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  38.52 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  32.26 
 
 
236 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  27.78 
 
 
237 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  32.8 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  28.57 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  31.68 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  25.64 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  30.89 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  31.41 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  31.25 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  28.33 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  30.5 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  34.59 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  31.61 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  30.89 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  30.89 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  30.89 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  30.89 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  31.77 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  32.29 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>