More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2917 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  40.81 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  42.71 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  42.19 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  41.63 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  40.95 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  43.81 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  45.15 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  37.39 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  39.5 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  41.74 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  40.65 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  42.21 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  36.02 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  41.75 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  35.85 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  39.49 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  37.9 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  36.21 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  46.79 
 
 		 184 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  38.62 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  36.29 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  36.55 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  40.74 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  42.58 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  32.32 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  32.32 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  38.24 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  32.92 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  37.97 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  39.9 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  37.82 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  41.79 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  36.02 
 
 		 237 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  38.46 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  36.64 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  34.18 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  35.1 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  35.44 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  34.18 
 
 		 236 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  39.41 
 
 		 235 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  36.36 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  35.62 
 
 		 389 aa  128  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  32.49 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  41.58 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  36.67 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  35.86 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  35.8 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  35.58 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  30.77 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  35.02 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  31.78 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  34.1 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  36.04 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  36 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  32.21 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  31.02 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  37.44 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  38.71 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  35.34 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  30.61 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  35.59 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  34 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  43.05 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  33.47 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  36.24 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  36.7 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  36.5 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  39.18 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  41.15 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  35.56 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  37.63 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  36.45 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  36.27 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  30.93 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  30.93 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  33.05 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  30.93 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  39.79 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  30.93 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  30.93 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  30.93 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.91 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  35.44 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  30.8 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  39.39 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  34.01 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  35.1 
 
 		 249 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  34.01 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  34.72 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  40.64 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  30.67 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  32.38 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>