More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0473 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  100 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  70.59 
 
 		 223 aa  337  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  35.06 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  36.91 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  36.06 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  36.21 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  37.83 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  36.02 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  34.5 
 
 		 229 aa  134  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 236 aa  134  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  33.9 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  34.21 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  33.74 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  36.21 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  35.23 
 
 		 235 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  33.92 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  33.48 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  36.61 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  33.49 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  35.36 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  32.79 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  34.09 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  35.26 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  35.75 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  31.6 
 
 		 389 aa  111  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  34.95 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  35.59 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  38.62 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  34.81 
 
 		 235 aa  104  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  34.13 
 
 		 184 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  34.29 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  34.08 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  34.68 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  35.75 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  37.96 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  35.68 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  35.63 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  37.41 
 
 		 235 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  35.23 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  32.61 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  36.17 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  32.98 
 
 		 237 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  32.98 
 
 		 237 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 247 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  34.76 
 
 		 241 aa  98.2  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  32.33 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  38.3 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  32.07 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  37.23 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  28.78 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  38.19 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  35.23 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  37.14 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  34.15 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  33.52 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  38.3 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  31.38 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  38.3 
 
 		 236 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  31.38 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  38.3 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  33.92 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  34.88 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  38.13 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  34.71 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  36.17 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  32.95 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  30.51 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  38.13 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  37.04 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  31.72 
 
 		 245 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29.73 
 
 		 255 aa  91.7  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  28.8 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  33.54 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.84 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  36.77 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  34.27 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  32.56 
 
 		 261 aa  89  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  35.71 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  31.15 
 
 		 238 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  28.64 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  30.5 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  35.75 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>