More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1837 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  100 
 
 		 243 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  44.59 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  40.43 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  43.6 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  41.98 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  44.13 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  40.26 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  39.47 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  39.15 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  36.05 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  36.13 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  40.54 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  36.99 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  32.75 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  34.33 
 
 		 228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  33.91 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  34.03 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  35.62 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  37.57 
 
 		 184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.9 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36.36 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  33.48 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  32.73 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  32.8 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  32.8 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  32.43 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  34.45 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  30.65 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  31.38 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  33.89 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  34.87 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  36.07 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  36.22 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  36.31 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  32.84 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  34.86 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  32.85 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  30.98 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  31.69 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  30.98 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  37.41 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  28.98 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  39.86 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  34.25 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  29.46 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  36.73 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  32.37 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  30.22 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  30.27 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  29.05 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  37.14 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  37.14 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  37.14 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  37.14 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  37.14 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  31.96 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  37.14 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  39.01 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  31.75 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  30.27 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  28.46 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  31.08 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  29.79 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  37.43 
 
 		 209 aa  99.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  37.33 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  33.53 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  34.24 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  32.46 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  35.05 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  30.63 
 
 		 239 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  30.77 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  34.04 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  34.53 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  32.61 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  31.05 
 
 		 389 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  29.06 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  31.02 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  29.8 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  32.97 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  32.57 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  30.18 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  31.07 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  30.18 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  32.58 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  32.24 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>