More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2565 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
238 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  59.15 
 
 
239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  53.39 
 
 
234 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  55.51 
 
 
242 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  52.97 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  51.95 
 
 
234 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  51.49 
 
 
235 aa  208  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  47.21 
 
 
241 aa  207  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  46.35 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  47.46 
 
 
234 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  44.4 
 
 
237 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  49.16 
 
 
233 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  44.35 
 
 
237 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  44.49 
 
 
231 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  44.3 
 
 
236 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  43.22 
 
 
237 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  43.28 
 
 
237 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  43.46 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  43.46 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  43.46 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  43.46 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  43.46 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  43.46 
 
 
236 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  43.04 
 
 
236 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  42.86 
 
 
232 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  41.92 
 
 
239 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  41.77 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  40.93 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  40.93 
 
 
236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  41.77 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  41.35 
 
 
236 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  41.35 
 
 
236 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  42.13 
 
 
236 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  42.92 
 
 
238 aa  161  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  40.6 
 
 
242 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  36.4 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  34.48 
 
 
235 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36.24 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.04 
 
 
227 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.04 
 
 
227 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  38.59 
 
 
230 aa  121  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  37.99 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  30.74 
 
 
227 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  35.54 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  31.95 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  35.86 
 
 
229 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  33.05 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  32.34 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  27.39 
 
 
229 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  31.71 
 
 
236 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  32.99 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  30.65 
 
 
243 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  35.32 
 
 
228 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  36.76 
 
 
288 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 
229 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  31.88 
 
 
228 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  35.32 
 
 
228 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  33.94 
 
 
230 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  32.29 
 
 
243 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  34.16 
 
 
247 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  31.61 
 
 
232 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  38.79 
 
 
233 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.92 
 
 
252 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  32.86 
 
 
244 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 
249 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  31.78 
 
 
239 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  36.84 
 
 
246 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  30.5 
 
 
245 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  33.99 
 
 
235 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 
239 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 
239 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  35.08 
 
 
245 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  33.19 
 
 
249 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 
239 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  31.88 
 
 
261 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  32.02 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  32.77 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  32.02 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 
251 aa  99  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  35.58 
 
 
233 aa  99  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  32 
 
 
254 aa  98.6  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  36.46 
 
 
234 aa  98.6  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  34.08 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  32.51 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  33.68 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  35.17 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  33.85 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  30.9 
 
 
226 aa  96.3  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  33.01 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.21 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  35.63 
 
 
389 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  36.36 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  33.85 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  31.19 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  28.33 
 
 
237 aa  92  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  28.33 
 
 
237 aa  92  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  28.28 
 
 
236 aa  92  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>