More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1214 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
229 aa  470  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  59.39 
 
 
231 aa  274  9e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  51.75 
 
 
232 aa  231  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  50.88 
 
 
239 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  48.89 
 
 
222 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  47.35 
 
 
228 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  46.46 
 
 
228 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  41.62 
 
 
230 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  40.31 
 
 
236 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  39.9 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  40.52 
 
 
228 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  42.86 
 
 
236 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  39.87 
 
 
228 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36.04 
 
 
237 aa  121  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36.04 
 
 
237 aa  121  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  38.12 
 
 
229 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  39.23 
 
 
229 aa  118  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  37.3 
 
 
241 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  35.62 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  37.93 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  38.73 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  38.41 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 
251 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  33.05 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  34.51 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  36.56 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  38.96 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  39.53 
 
 
245 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  33.33 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  38.12 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  41.89 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  36.31 
 
 
243 aa  109  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  38.42 
 
 
245 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  31.56 
 
 
233 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  36.44 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  44.76 
 
 
242 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  33.49 
 
 
282 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  32.3 
 
 
240 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  35.64 
 
 
218 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  39.35 
 
 
234 aa  106  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 
242 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  34.17 
 
 
244 aa  105  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 
232 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  34.84 
 
 
233 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  37.58 
 
 
227 aa  105  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  34.68 
 
 
231 aa  105  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  39.44 
 
 
237 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  28.99 
 
 
245 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  34.52 
 
 
242 aa  104  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  37.66 
 
 
233 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  31.02 
 
 
249 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  30.4 
 
 
229 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  35.57 
 
 
231 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  30.64 
 
 
237 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  29.41 
 
 
245 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  29.35 
 
 
243 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  37.37 
 
 
232 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  33.33 
 
 
232 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  38.1 
 
 
236 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 
232 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  38.1 
 
 
228 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  37.84 
 
 
226 aa  102  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  33.84 
 
 
237 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  31.63 
 
 
220 aa  102  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  39.86 
 
 
224 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  32.74 
 
 
255 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  40.29 
 
 
234 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  35.85 
 
 
222 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  34 
 
 
238 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.11 
 
 
224 aa  99.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
233 aa  99  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  37.41 
 
 
236 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  37.41 
 
 
236 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  37.41 
 
 
236 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  37.41 
 
 
236 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  37.41 
 
 
236 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  35.35 
 
 
288 aa  98.6  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  39.61 
 
 
389 aa  98.6  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  33.83 
 
 
258 aa  98.6  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  38.1 
 
 
236 aa  98.2  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  36.67 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  34.36 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  32.84 
 
 
249 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  36.61 
 
 
261 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  35.29 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  33.16 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  39.33 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  32.8 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  34.04 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  32.8 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  37.2 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  38.3 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  39.19 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  32.12 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>