More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2388 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  74.58 
 
 		 245 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  58.68 
 
 		 247 aa  294  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  56.96 
 
 		 282 aa  258  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  45.2 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  40.27 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  40.64 
 
 		 224 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  41.08 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  40.55 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  32.88 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  34.69 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  41.94 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  34.87 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  36.22 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  38.97 
 
 		 247 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  34.36 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  34.07 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  32.92 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  34.02 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  41.52 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  36.36 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  36.02 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  41.15 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  41.15 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  35.02 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  35.74 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  32.88 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  35.25 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  34.17 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  37.02 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  31.95 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  37.3 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  37.76 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  32.23 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  31.49 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  39.46 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  41.22 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  36.44 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  32.88 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  39.15 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  34.55 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  37.61 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  39.65 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  34.15 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  36.65 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  39 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  39.18 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  34.15 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  38.62 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  39.89 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  39.04 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  33.33 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  38.1 
 
 		 222 aa  102  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  37.7 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  31.49 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  33.15 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  29.17 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  34.63 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  36.36 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  37.74 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  41.18 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  41.61 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  38.22 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  35.29 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  32.46 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  40.2 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  38.66 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  35.03 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  39.44 
 
 		 232 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  35.26 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  37.43 
 
 		 234 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  35.98 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  37.37 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  32.62 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  37.75 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  34.75 
 
 		 236 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  37.1 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  34.62 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  33.48 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  34.57 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>