More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3577 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  100 
 
 
232 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  89.43 
 
 
228 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  39.57 
 
 
236 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  40.26 
 
 
236 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  42.19 
 
 
237 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  42.19 
 
 
237 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  36.03 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  41.2 
 
 
389 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 
237 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  34.5 
 
 
227 aa  143  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  44.08 
 
 
236 aa  141  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  36.91 
 
 
237 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  37.97 
 
 
236 aa  134  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  34.76 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  42.19 
 
 
237 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  44.93 
 
 
229 aa  132  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  36.14 
 
 
229 aa  132  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  35.93 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  39.51 
 
 
237 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  36.21 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  36.21 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  35.93 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  39.68 
 
 
236 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  34 
 
 
220 aa  128  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  39.47 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  35.06 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  40.31 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  40.31 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  35.78 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  40.31 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  38.95 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  40.31 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  34.47 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  40.43 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  40.31 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  40.31 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  36.06 
 
 
288 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  38.92 
 
 
233 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  39.79 
 
 
236 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  39.38 
 
 
239 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  44.44 
 
 
229 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 
227 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 
227 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  44.23 
 
 
238 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  37.79 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  35.36 
 
 
222 aa  118  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  36.23 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  37.89 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  35.68 
 
 
237 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 
223 aa  115  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  42.61 
 
 
226 aa  115  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 
234 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  41.14 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  36.36 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  35.9 
 
 
230 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  27.63 
 
 
229 aa  113  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  36.48 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  41.43 
 
 
233 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  34.91 
 
 
228 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  33.91 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  37.7 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  37.17 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  35.52 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  36.19 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.05 
 
 
228 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  34.88 
 
 
239 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  41.29 
 
 
233 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  34.17 
 
 
247 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  44.29 
 
 
184 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  38.27 
 
 
231 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  31.65 
 
 
243 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  38.86 
 
 
242 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  34.63 
 
 
241 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  44.52 
 
 
257 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  30.61 
 
 
243 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  39.86 
 
 
243 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  32.24 
 
 
251 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 
243 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  32.64 
 
 
245 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  32.71 
 
 
251 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  39.44 
 
 
235 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  35.76 
 
 
228 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.66 
 
 
245 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  38.38 
 
 
231 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
229 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  37.1 
 
 
232 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  35.1 
 
 
228 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  32.12 
 
 
245 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  36.18 
 
 
235 aa  101  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.95 
 
 
238 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  32.03 
 
 
242 aa  101  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  33.87 
 
 
261 aa  101  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  34.75 
 
 
231 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  35.98 
 
 
235 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  33.49 
 
 
248 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  38.5 
 
 
245 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  31.65 
 
 
244 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  36.79 
 
 
232 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  32.09 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>