More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0596 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  55.7 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  52.21 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  49.36 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  44.05 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  48.04 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  47.44 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  46.86 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  49.23 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  40.71 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  38.86 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  37.55 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  37.55 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  40.26 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  43.81 
 
 		 238 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  40.67 
 
 		 226 aa  165  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  43.78 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  41.51 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  42.21 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  42.21 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  41.34 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  42 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  41.21 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  35.81 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  39.9 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  38.78 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  34.17 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  40.11 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  39.7 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  40.11 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  40.7 
 
 		 184 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  40.32 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  37.84 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  33.91 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  40.11 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  41.44 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  37.37 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  40.33 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  37.37 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  38.61 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  38.42 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  37.96 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  38.12 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  32.22 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  40.96 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  38.12 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  37.69 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  38.12 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  38.22 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  37.62 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  38.86 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.16 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  35.75 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  38.95 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  32.2 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  31.51 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  35.75 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  38.69 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  31.51 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  37.43 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  39.73 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  31.6 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  31.6 
 
 		 238 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  36.27 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  35.12 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  35.12 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  32.08 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  35.12 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  35.44 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  35.29 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  37.02 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  37.29 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  33.8 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  33.02 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  34.21 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  38.67 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  39.72 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  33.71 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  33.85 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  37.37 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  41.29 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  34.38 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  36.04 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  35.52 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  37.66 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>