More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2986 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
239 aa  487  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  49.35 
 
 
232 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  50.88 
 
 
229 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  47.14 
 
 
231 aa  210  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  43.61 
 
 
228 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  42.92 
 
 
228 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  42.17 
 
 
222 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  41.72 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  38.19 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  42.95 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  38.81 
 
 
242 aa  125  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  42.77 
 
 
245 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  34.93 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  35.83 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  35.27 
 
 
238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  34.86 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  38.78 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  35.23 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  38.92 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  32.59 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  37.11 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  33.7 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  32.3 
 
 
249 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  35.95 
 
 
237 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  35.95 
 
 
237 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  37.1 
 
 
224 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  31.25 
 
 
230 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  36.88 
 
 
227 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  38.71 
 
 
241 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 
242 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  38.51 
 
 
235 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  34.29 
 
 
220 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.15 
 
 
231 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  34.55 
 
 
254 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  30.61 
 
 
233 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  38.6 
 
 
237 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  36.09 
 
 
238 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  33 
 
 
246 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  37.23 
 
 
218 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  31.91 
 
 
237 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  32.42 
 
 
231 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  35.44 
 
 
233 aa  105  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  31.28 
 
 
229 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  31.89 
 
 
229 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  38.1 
 
 
237 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.14 
 
 
238 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  38.13 
 
 
236 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  37.43 
 
 
245 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 
246 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 
227 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  29.74 
 
 
237 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 
227 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  32.23 
 
 
282 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 
236 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 
236 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 
236 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 
236 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 
236 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  41.72 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  35.25 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  37.42 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  37.75 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  36.49 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  35.53 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  35.53 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  35.53 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  29.41 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  36.21 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  34.95 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  28.41 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  34.53 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  35.36 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  35.33 
 
 
233 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  34.53 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  35.97 
 
 
236 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  38.3 
 
 
243 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  36.54 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  33.81 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  33.81 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  33.05 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  29.32 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  38.01 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  29.48 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  34.48 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  37.59 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 
247 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  31.82 
 
 
228 aa  92  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  33.11 
 
 
238 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.64 
 
 
224 aa  91.7  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  37.5 
 
 
276 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  34.33 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  31.25 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  33.81 
 
 
241 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  31.82 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  33.14 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  32.43 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>