More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5138 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  100 
 
 
238 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  61.9 
 
 
241 aa  294  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  42.06 
 
 
233 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  40.95 
 
 
249 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  39.57 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  42.25 
 
 
228 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  34.78 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  37.27 
 
 
228 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 
255 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  36.6 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  40.27 
 
 
253 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  38.97 
 
 
264 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  43.72 
 
 
275 aa  128  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  36.48 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  36.07 
 
 
232 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  37.1 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  40.2 
 
 
248 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  34.26 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 
282 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  46.22 
 
 
243 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.46 
 
 
241 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  46.2 
 
 
249 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  36.09 
 
 
239 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  36.65 
 
 
254 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  32.19 
 
 
249 aa  105  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 
236 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  35.6 
 
 
237 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  36.07 
 
 
222 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  34.92 
 
 
250 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 
247 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  36.88 
 
 
228 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  39.41 
 
 
247 aa  101  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  30.73 
 
 
229 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  34.01 
 
 
228 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  37 
 
 
247 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.16 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
233 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  32.12 
 
 
229 aa  99.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  35.23 
 
 
250 aa  99.4  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  36.55 
 
 
249 aa  99  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  31.18 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  29.06 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  34.57 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.12 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  34.07 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  33.04 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  30.5 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  28.26 
 
 
251 aa  95.9  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  35.42 
 
 
245 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  32.24 
 
 
238 aa  95.1  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4908  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  32.47 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231042  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  37.31 
 
 
235 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
238 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  32.98 
 
 
232 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.29 
 
 
245 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  31.72 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  30.94 
 
 
240 aa  92.4  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  31.42 
 
 
245 aa  92  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  30.56 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  31.53 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  32.04 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  29.56 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  34.65 
 
 
947 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  35.23 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  30.94 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  32.93 
 
 
231 aa  89.4  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  31.38 
 
 
227 aa  89  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  31.38 
 
 
227 aa  89  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  33.83 
 
 
261 aa  88.6  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  35.29 
 
 
288 aa  88.6  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  31.98 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  27.51 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  32.61 
 
 
226 aa  85.5  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  26.58 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.31 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  32.22 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  32.58 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  34.34 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  30.53 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  28.21 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  35 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  30.59 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  31.16 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  33.69 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.81 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  35.42 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  30.95 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  31.22 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  33.85 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  29.8 
 
 
241 aa  82  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  36.16 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  34.83 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  29.73 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>