177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4908 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4908  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  100 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  40.73 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  44.39 
 
 		 264 aa  141  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  34.18 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  35.19 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  35.78 
 
 		 249 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  36.24 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  32.47 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  31.76 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  29.83 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  27.27 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  26.63 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  27.7 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  32.04 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  25.26 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  25.82 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  25 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  29.28 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  31.5 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  32.73 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  29.17 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  27.32 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  28.65 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  25.54 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  24.77 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  25 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  28.8 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  25.35 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  29.93 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  28.34 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  31.11 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  32.46 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  30.14 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  27.47 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  30.22 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  26.82 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  26.95 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  29.17 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  27.42 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  28.74 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  28.07 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  23.44 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  25.11 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  28.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  28.65 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  24.29 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  30.98 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  27.93 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  26.94 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  30.59 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  29.86 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  25.93 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  32.11 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  30.51 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  24.6 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  28.25 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  31.58 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  23.67 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  25.29 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  23.63 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  27.54 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  27.71 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  29.78 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  23.12 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  26.22 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  28.95 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  31.14 
 
 		 389 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  28.4 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  28.24 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  24.3 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  22.87 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  29.63 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  27.17 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  25 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  23.7 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  30.16 
 
 		 237 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  23.89 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  23.03 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  25.52 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  23.98 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  31.02 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  27.12 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  24.47 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  27.81 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  24.47 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  26.24 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  27.14 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  29.59 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  31.82 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  31.06 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  32.5 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>