More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2521 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  75.53 
 
 		 241 aa  362  4e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  55.19 
 
 		 240 aa  261  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  56.6 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  45.96 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  45.45 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  43.57 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  41.3 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  41.63 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  41.35 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  37.44 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  41.24 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  42.13 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  44.21 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  38.5 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  38.86 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  38.89 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  38.07 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  36.04 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  31.6 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  36.79 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  39.15 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  34.43 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  35.09 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  33.86 
 
 		 189 aa  90.1  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  28.5 
 
 		 258 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  31.09 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  37.59 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  34.32 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  36.3 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  38.03 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  32.32 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  29.15 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  33.72 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  34.76 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  33.54 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  33.94 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.39 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  38.17 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  29.79 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  41.21 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  31.4 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6777  glutamine amidotransferase class-I  35.76 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430995  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  30.69 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.93 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  37.75 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  38.1 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  33.49 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  37.75 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  35.03 
 
 		 540 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  26.21 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  30.07 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  41.75 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  26.05 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  31.52 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  38.6 
 
 		 516 aa  72.8  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  28.02 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  29.89 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  26.47 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  32.64 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  30.12 
 
 		 244 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  35.76 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  39.25 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.72 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  26.15 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  29.61 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.72 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  36.72 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  34.32 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  28.65 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  29.89 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  29.94 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  37.61 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  28.12 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  29.05 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  31.34 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  32.79 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  33.14 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  31.07 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  35.54 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  29.41 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  33.88 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  28.33 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  34.01 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  25.91 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  32.32 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  30.99 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  35.54 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  30.38 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  32.24 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>