More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2980 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  100 
 
 
260 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  76.13 
 
 
247 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  59.83 
 
 
242 aa  277  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  60 
 
 
244 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  59.24 
 
 
264 aa  275  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  58.9 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  55.42 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  55.42 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  57.74 
 
 
243 aa  265  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  52.5 
 
 
260 aa  251  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  55.42 
 
 
243 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  47.74 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  46.86 
 
 
242 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  45.87 
 
 
245 aa  205  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  47.7 
 
 
243 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  45.6 
 
 
264 aa  188  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  39.22 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  30.23 
 
 
232 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  40.91 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  32.6 
 
 
258 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  42.86 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 
241 aa  85.5  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  35.17 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  32.69 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  37.32 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  35.09 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  30.29 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  42.11 
 
 
229 aa  82  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  40.52 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  33.69 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.05 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  37.32 
 
 
233 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.73 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  34.87 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  30.37 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  32.69 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  32.87 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  29.39 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.76 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  35.57 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  38.6 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  32.41 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  33.14 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  36.25 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  31.01 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  35.26 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  35.26 
 
 
236 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  33.54 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  32.43 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  25.69 
 
 
513 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  35.4 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  31.13 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  33.53 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  33.53 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  31.08 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  28.21 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  31.86 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  24.63 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  29.73 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  29.19 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  27.33 
 
 
507 aa  68.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  30.46 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  34.68 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  34.01 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  31.51 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  34.01 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  42.42 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  36.52 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  30.28 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  34.68 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  32.86 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  33.56 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  33.1 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  28.57 
 
 
511 aa  67  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  33.81 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  29.29 
 
 
522 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  32.85 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  32.95 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  32.87 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  32.95 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  28.24 
 
 
560 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  29.73 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  29.34 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  40 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  27.06 
 
 
560 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  27.65 
 
 
533 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  32.53 
 
 
232 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  30.2 
 
 
525 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>