More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4570 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 243 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  57.5 
 
 		 244 aa  284  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  60.17 
 
 		 264 aa  284  9e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  58.85 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  58.51 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  58.85 
 
 		 244 aa  271  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  55.42 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  54.32 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  55.14 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  57.44 
 
 		 243 aa  255  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  53.56 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  46.53 
 
 		 245 aa  221  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  48.36 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  45.23 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  48 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  45.45 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  39.26 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  36.81 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  30.58 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  39.58 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  34.8 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  37.28 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  39.64 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  34.16 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  38.41 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  36.65 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  35.94 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  35.26 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  36.69 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  34.62 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  31.41 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  30.72 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  41.96 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  37.61 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  34.66 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  35.37 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  35.92 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  32.26 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  26 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  33.53 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  35 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  31.66 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  32.67 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  35.44 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  30.54 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  35.9 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  39 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  36.84 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  28.67 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  40.28 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  37.38 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  36.44 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  28.67 
 
 		 560 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  32.91 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  33.94 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  29.38 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  30.2 
 
 		 525 aa  69.3  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  31.58 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  30.91 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.73 
 
 		 530 aa  68.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  30.61 
 
 		 525 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  41.74 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  30.99 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  25.53 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  36.79 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  27.38 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  30.06 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  40.82 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  32.45 
 
 		 506 aa  65.5  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  33.12 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  31.74 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  31.93 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  28.3 
 
 		 525 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  31.22 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  34.5 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  27.67 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  29.25 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  31.53 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  29.95 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  27.46 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  27.67 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  27.67 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  31.21 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  33.12 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  27.67 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  29.58 
 
 		 189 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  27.22 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  31.68 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  36.49 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  26.57 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  27.59 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  28.65 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  35.67 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  30.07 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>