More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4275 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 308 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0165  glutamine amidotransferase class-I  75.87 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6777  glutamine amidotransferase class-I  48.74 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  47.1 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  44.84 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  44.13 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  45.2 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  46.52 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  36.81 
 
 		 233 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  34.21 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  35.67 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  31.68 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  26.78 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  31.41 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  30.46 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  32.31 
 
 		 248 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  33.94 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  31.87 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  33.02 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  28.14 
 
 		 243 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  29.92 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  31.79 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  36.55 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  32.92 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  28.95 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  30.19 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.09 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.92 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  33.9 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  35.25 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  32.42 
 
 		 527 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  29.65 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  29.07 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  34.53 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  30.67 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  33.15 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  34.53 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  34.53 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  31.68 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  34.53 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  32.06 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  29.07 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.37 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  27.23 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  33.88 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  29.29 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  29.29 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  30.13 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  31.64 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  30.13 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  28.7 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  29.49 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  31.65 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.89 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  29.94 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  28.39 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  32.47 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  27.36 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  31.25 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  31.25 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  32.17 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  33.97 
 
 		 238 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  30.37 
 
 		 522 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  31.25 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  32.23 
 
 		 222 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  30.13 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  32.5 
 
 		 244 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  30.92 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  30 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  26.74 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  30.2 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  30.67 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  31.46 
 
 		 533 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  28.86 
 
 		 513 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  30.66 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  27.27 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  29.79 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  31.53 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  31.47 
 
 		 528 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0650  GMP synthase  25 
 
 		 526 aa  55.5  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.331124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  30.77 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  28.97 
 
 		 525 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  28 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  34 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  28.26 
 
 		 513 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  26.53 
 
 		 517 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  33.71 
 
 		 264 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  30.43 
 
 		 514 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  30.29 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  30.29 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  26.67 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>