More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7211 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  100 
 
 		 276 aa  554  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0165  glutamine amidotransferase class-I  47.1 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  47.1 
 
 		 308 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6777  glutamine amidotransferase class-I  48.91 
 
 		 284 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  45.09 
 
 		 305 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  44.73 
 
 		 286 aa  228  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  45.99 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  45.82 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  44.36 
 
 		 282 aa  215  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  36.99 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  32.02 
 
 		 250 aa  89.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  35.8 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  38.3 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  34.66 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  36.2 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  35.67 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  38.67 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  37.66 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  35 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  31.73 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  29.78 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  37.96 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  32.37 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  28.92 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  36.67 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  34.78 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  33.33 
 
 		 522 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  29.89 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0650  GMP synthase  27.78 
 
 		 526 aa  68.9  0.00000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.331124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  31.22 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  30.43 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  33.99 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  30.98 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  27.75 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.83 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  33.17 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  35.15 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  34.75 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  28.48 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  34.86 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  33.11 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  32.19 
 
 		 521 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  33.11 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  30.23 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  30.98 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  29.87 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  31.1 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  29.31 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  28.93 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  37.24 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  28.8 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.12 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  32.61 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  31.87 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  27.98 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  31.58 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  29.07 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  28.12 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  30.86 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  31.07 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  30.99 
 
 		 525 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  30.77 
 
 		 526 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  32.19 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  33.56 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  29.73 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  32.9 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  29.17 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  37.72 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  31.16 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  31.65 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  28.37 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  30.86 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  33.04 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  31.52 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  29.87 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  29.87 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  26.16 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02180  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  29.86 
 
 		 544 aa  57  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  29.63 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  31.69 
 
 		 510 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  27.54 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  23.71 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  30.38 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  30.56 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  29.93 
 
 		 540 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  33.33 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  27.43 
 
 		 525 aa  56.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  27.08 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>