More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1509 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  34.48 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  39.15 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  31.69 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  42.55 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  36.89 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  34.45 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  32.54 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  36.84 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  30.34 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  36.02 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  32.38 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  30.93 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  35.64 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  31.22 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  33.17 
 
 		 242 aa  85.1  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  36.49 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  34.21 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  35 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  28.57 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  30.58 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  29.41 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  30.39 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  29.81 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  37.09 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  35.48 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  29.06 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  31.72 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  27.72 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  32.56 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  36.3 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  32.18 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  30.77 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  33.01 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  27.87 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  32.67 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  33.12 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  32.64 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  33.56 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  36.94 
 
 		 513 aa  73.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  32.1 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  29.83 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  35.4 
 
 		 244 aa  72  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  29.17 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  32.59 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  31.43 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  32.2 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  31.87 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  32.75 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  37.5 
 
 		 522 aa  69.3  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  30.43 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  26.29 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  31.51 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  28.49 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  35.44 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  31.51 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  37.96 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  34.19 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  34.34 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  35.76 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  34.29 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  35.97 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  35.97 
 
 		 521 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  32.93 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  35.97 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  28.68 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  29.83 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  23.59 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.61 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0969  anthranilate synthase/para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase subunit  32.08 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  31.09 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  26.57 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  35.97 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  31.77 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  32.26 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  31.91 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  31.65 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6777  glutamine amidotransferase class-I  29.5 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  31.58 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.48 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  29.05 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  33.82 
 
 		 518 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  37.25 
 
 		 533 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  35.38 
 
 		 521 aa  62  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.77 
 
 		 536 aa  62  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>