More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2563 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  45.76 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  51.3 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  43.59 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  44.44 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  48.47 
 
 		 247 aa  203  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  47.41 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  44.44 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  46.15 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  44.21 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  39.91 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  40.35 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  41.59 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  38.6 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  36.75 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  37.72 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  38.16 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  40.49 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  41.24 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  39.42 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  42.34 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  37.78 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  39.39 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  33.69 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  35.76 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  32.31 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  34.29 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  34.8 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  40.13 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  36.9 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  43.65 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  36.99 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  35.55 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  31.53 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  32.18 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  37.58 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.36 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  31.21 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  37.58 
 
 		 278 aa  85.1  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  35.67 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  34.29 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  36.11 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  34.66 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  32.28 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  30.11 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  30.69 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  35.04 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  35.11 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  30.11 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  32.65 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  36.99 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6777  glutamine amidotransferase class-I  36.61 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  35.26 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  32.06 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  29.84 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  33.72 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  31.97 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  33.7 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  35.33 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.54 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  34.75 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  31.12 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  29.07 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  43.08 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  35.56 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  33.82 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  31.85 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  31.1 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  33.82 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  31.08 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  35.38 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  39.1 
 
 		 507 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  36.55 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  34.64 
 
 		 537 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  28.57 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  42.06 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  33.09 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  36.77 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  32.34 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  28.73 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  32.58 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  29.38 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0165  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  30 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  29.41 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  34.13 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  39.1 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>