More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3627 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
223 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  40.95 
 
 
213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  38.46 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  36.84 
 
 
525 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 
238 aa  79  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  41.67 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  36.88 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  34.16 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  37.66 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.49 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  36.71 
 
 
238 aa  72  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  33.93 
 
 
243 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  31.62 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  32.26 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3102  glutamine amidotransferase class-I  34.07 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.830668  normal  0.133558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  32.78 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  30.25 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  35.42 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  35.42 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  33.57 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  32.22 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  37.88 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  30.19 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  29.65 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  34 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  27.66 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  35.03 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  31.01 
 
 
516 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  31.67 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  31.67 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  32.19 
 
 
506 aa  65.5  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  31.97 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  30.71 
 
 
512 aa  65.1  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  29.7 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  32.88 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  34.09 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  36.18 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  30.61 
 
 
505 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  33.59 
 
 
510 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  31.3 
 
 
542 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  34.33 
 
 
517 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  29.08 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  26.79 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  30.24 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  30.56 
 
 
507 aa  62.4  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  30.95 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  26.86 
 
 
528 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  32.68 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  31.62 
 
 
511 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1637  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  39.09 
 
 
204 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.692068 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  33.33 
 
 
529 aa  62.4  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  33.58 
 
 
528 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  31.58 
 
 
230 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  31.61 
 
 
233 aa  62  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 
245 aa  62  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  28.79 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  30.56 
 
 
528 aa  61.6  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  38.61 
 
 
191 aa  62  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  30.56 
 
 
513 aa  61.6  0.000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  33.33 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  27.41 
 
 
507 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  32.33 
 
 
516 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  33.99 
 
 
243 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  32.09 
 
 
526 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  29.55 
 
 
511 aa  60.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4275  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  37.38 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734934  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  29.49 
 
 
527 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0498  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  40.38 
 
 
642 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  26.7 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0052  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  39.22 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  26.19 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3906  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  37.38 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  32.09 
 
 
518 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  30.17 
 
 
517 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  31.87 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  31.54 
 
 
542 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  32.35 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  31.54 
 
 
542 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  30.15 
 
 
537 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  33.59 
 
 
510 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  28.1 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  29.2 
 
 
505 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6135  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  37.5 
 
 
189 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  32.35 
 
 
189 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  30.5 
 
 
528 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  38.24 
 
 
534 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  30.57 
 
 
228 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00740  anthranilate synthase, component II  36.7 
 
 
217 aa  58.5  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  31.34 
 
 
520 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.33 
 
 
539 aa  58.2  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4378  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  37 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.868162  normal  0.946772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  32.33 
 
 
519 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  30.94 
 
 
512 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  33.78 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>