More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0052 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0052  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  100 
 
 
201 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0052  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  86.57 
 
 
201 aa  352  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3906  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  81.73 
 
 
209 aa  327  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4275  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  81.22 
 
 
209 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734934  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4378  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  82.38 
 
 
209 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.868162  normal  0.946772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1637  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  77.04 
 
 
204 aa  308  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.692068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1138  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.46 
 
 
198 aa  249  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.021908  normal  0.736059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  63.64 
 
 
193 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2037  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.22 
 
 
225 aa  232  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.388628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.11 
 
 
197 aa  230  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2397  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.3 
 
 
194 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  57.22 
 
 
190 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  55.26 
 
 
189 aa  225  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  54.97 
 
 
190 aa  225  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  55.03 
 
 
188 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4169  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.6 
 
 
204 aa  224  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  56.99 
 
 
190 aa  223  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.99 
 
 
190 aa  223  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.16 
 
 
197 aa  223  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0375  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.92 
 
 
193 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083636 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4053  anthranilate synthase, component II  57.53 
 
 
204 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.53 
 
 
204 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  55.38 
 
 
187 aa  221  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.38 
 
 
187 aa  221  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  53.68 
 
 
189 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  55.38 
 
 
187 aa  221  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  55.38 
 
 
187 aa  221  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  55.38 
 
 
187 aa  221  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  55.38 
 
 
187 aa  221  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  55.32 
 
 
187 aa  221  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  54.84 
 
 
187 aa  220  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  55.38 
 
 
187 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  53.16 
 
 
189 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  54.84 
 
 
187 aa  220  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  55.38 
 
 
187 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  55.38 
 
 
187 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  55.38 
 
 
187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  55.38 
 
 
187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  55.03 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  55.38 
 
 
195 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0784  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  49.25 
 
 
546 aa  218  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.919428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  54.84 
 
 
187 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  53.16 
 
 
189 aa  218  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46130  anthranilate synthase component II  57.59 
 
 
197 aa  216  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0907  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  51.55 
 
 
201 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000149415  hitchhiker  0.00000000332325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  52.08 
 
 
195 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  53.97 
 
 
191 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5115  anthranilate synthase component II  53.54 
 
 
197 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  54.59 
 
 
190 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  57.07 
 
 
192 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0592  anthranilate synthase, component II  53.5 
 
 
199 aa  214  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747776  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4455  anthranilate synthase component II  53.51 
 
 
190 aa  214  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1401  anthranilate synthase component II  54.5 
 
 
196 aa  214  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.579045  hitchhiker  0.000682875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2749  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.3 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.466062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0368  anthranilate synthase component II  54.05 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  51.83 
 
 
191 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3227  anthranilate synthase, component II  59.36 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
544 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0807  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  48.76 
 
 
546 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.88 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  53 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.13 
 
 
188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4783  anthranilate synthase component II  55.5 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4187  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49 
 
 
199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  54.97 
 
 
197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2196  para-aminobenzoate synthase component II  53.16 
 
 
193 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3946  anthranilate synthase component II  53.93 
 
 
198 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  50.54 
 
 
189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  52.66 
 
 
187 aa  211  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  52.15 
 
 
190 aa  210  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0453  anthranilate synthase component II  55.5 
 
 
197 aa  210  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3580  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.59 
 
 
226 aa  210  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0378393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3462  anthranilate synthase, component II  54.69 
 
 
189 aa  210  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.772396  normal  0.100457 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  53.4 
 
 
197 aa  210  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  54.97 
 
 
201 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0420  anthranilate synthase component II  54.97 
 
 
197 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0538249  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1252  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component II  52.41 
 
 
200 aa  209  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.4 
 
 
188 aa  208  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.708014  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5574  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.21 
 
 
206 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4125  anthranilate synthase, component II  51.56 
 
 
191 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1093  anthranilate synthase component II  45.83 
 
 
196 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0614431  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00501  P-aminobenzoate synthetase, component II  54.74 
 
 
194 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  53.48 
 
 
188 aa  208  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  53.19 
 
 
190 aa  208  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0575  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  53.68 
 
 
195 aa  208  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267305  normal  0.552155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0526  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50 
 
 
202 aa  208  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  50.79 
 
 
192 aa  208  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0613  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  51.85 
 
 
191 aa  208  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00080  para-aminobenzoate synthase component II  50.52 
 
 
195 aa  208  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3878  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  53.23 
 
 
188 aa  208  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1271  anthranilate synthase component II  45.83 
 
 
196 aa  207  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.8553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  53.93 
 
 
201 aa  207  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3015  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  52.63 
 
 
216 aa  207  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067902  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1775  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.3 
 
 
206 aa  207  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3720  anthranilate synthase component II  52.88 
 
 
195 aa  206  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.6 
 
 
191 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0597  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.74 
 
 
199 aa  206  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2321  anthranilate synthase, component II  54.74 
 
 
195 aa  206  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0251502  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0985  anthranilate synthase component II  53.27 
 
 
213 aa  206  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0701376  normal  0.146599 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1475  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.56 
 
 
196 aa  206  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00621509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>