More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2397 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2397  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4378  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.89 
 
 
209 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.868162  normal  0.946772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4275  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.37 
 
 
209 aa  231  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734934  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3906  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.37 
 
 
209 aa  231  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0052  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.11 
 
 
201 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  56.08 
 
 
189 aa  229  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0052  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.3 
 
 
201 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.75 
 
 
188 aa  219  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1637  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.69 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.692068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.28 
 
 
197 aa  218  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2037  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54 
 
 
225 aa  216  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.388628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.22 
 
 
188 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  56.76 
 
 
187 aa  214  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  54.59 
 
 
188 aa  215  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  54.05 
 
 
189 aa  214  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  56.84 
 
 
192 aa  214  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0592  anthranilate synthase, component II  55.28 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  52.43 
 
 
195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  52.43 
 
 
195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  55.28 
 
 
199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  52.43 
 
 
195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.11 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.56 
 
 
191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  55.14 
 
 
187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  55.14 
 
 
187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.14 
 
 
187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  55.14 
 
 
187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  55.14 
 
 
187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  55.14 
 
 
187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  52.43 
 
 
195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  54.05 
 
 
189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  54.05 
 
 
189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.68 
 
 
193 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.42 
 
 
197 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3855  para-aminobenzoate synthase component II  56.08 
 
 
191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
544 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49.21 
 
 
200 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.84 
 
 
197 aa  211  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  54.59 
 
 
187 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3705  para-aminobenzoate synthase component II  52.88 
 
 
191 aa  209  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3948  para-aminobenzoate synthase component II  52.88 
 
 
191 aa  209  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  55.14 
 
 
187 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0244  para-aminobenzoate synthase component II  52.88 
 
 
191 aa  209  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0673282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0907  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  51.05 
 
 
201 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000149415  hitchhiker  0.00000000332325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  51.89 
 
 
195 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  51.35 
 
 
195 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  53.51 
 
 
190 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  51.35 
 
 
195 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2749  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.3 
 
 
197 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.466062  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0784  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
546 aa  209  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.919428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  55.56 
 
 
238 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1775  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.08 
 
 
206 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  54.59 
 
 
187 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4187  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.05 
 
 
199 aa  208  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  54.05 
 
 
191 aa  208  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  50 
 
 
195 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  51.35 
 
 
195 aa  208  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  51.35 
 
 
195 aa  208  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  51.35 
 
 
195 aa  208  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.88 
 
 
192 aa  207  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5115  anthranilate synthase component II  55.79 
 
 
197 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  52.97 
 
 
188 aa  206  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  50.26 
 
 
192 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4169  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.68 
 
 
204 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4783  anthranilate synthase component II  55.33 
 
 
197 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  51.89 
 
 
189 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0807  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
546 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2801  anthranilate synthase component II  53.68 
 
 
202 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0375  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.98 
 
 
193 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083636 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.14 
 
 
204 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.63 
 
 
190 aa  205  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0367  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  51.6 
 
 
192 aa  205  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  52.63 
 
 
190 aa  205  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0752  anthranilate synthase, component II  51.58 
 
 
192 aa  205  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  54.82 
 
 
197 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4053  anthranilate synthase, component II  54.59 
 
 
204 aa  204  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  53.44 
 
 
190 aa  204  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  51.35 
 
 
188 aa  204  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  54.17 
 
 
192 aa  204  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  52.76 
 
 
201 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  54.59 
 
 
187 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  54.59 
 
 
187 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  53.23 
 
 
204 aa  204  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0420  anthranilate synthase component II  53.81 
 
 
197 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0538249  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  50.53 
 
 
195 aa  203  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  54.59 
 
 
187 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46130  anthranilate synthase component II  55.79 
 
 
197 aa  203  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  52.97 
 
 
189 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1895  anthranilate synthase, component II  54.64 
 
 
196 aa  203  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.408406  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0607  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  53.16 
 
 
203 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00205694  normal  0.186857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3946  anthranilate synthase component II  55.26 
 
 
198 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0806  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  49.74 
 
 
197 aa  203  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000445998  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4583  para-aminobenzoate synthase component II  52.91 
 
 
191 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0453  anthranilate synthase component II  53.81 
 
 
197 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4455  anthranilate synthase component II  50.54 
 
 
190 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  51.63 
 
 
190 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  54.59 
 
 
187 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3423  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  53.16 
 
 
196 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585956  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2729  para-aminobenzoate synthase component II  52.11 
 
 
192 aa  202  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3720  anthranilate synthase component II  55.26 
 
 
195 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.865312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>