More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3196 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  100 
 
 
190 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0806  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  81.38 
 
 
197 aa  324  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000445998  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0607  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  78.95 
 
 
203 aa  322  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00205694  normal  0.186857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0606  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  78.95 
 
 
191 aa  321  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3423  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  78.95 
 
 
196 aa  320  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585956  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3758  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  78.95 
 
 
194 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000630445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3884  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  78.95 
 
 
194 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.012296  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0613  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  78.42 
 
 
191 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0567  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  78.95 
 
 
194 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000013405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3701  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  78.42 
 
 
194 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000872657  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0575  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  77.37 
 
 
195 aa  316  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267305  normal  0.552155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3302  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  78.07 
 
 
189 aa  315  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3519  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  79.79 
 
 
190 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3015  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  76.06 
 
 
216 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067902  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0641  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  76.06 
 
 
192 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4160  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  77.01 
 
 
190 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2196  para-aminobenzoate synthase component II  65.98 
 
 
193 aa  256  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0244  para-aminobenzoate synthase component II  62.83 
 
 
191 aa  255  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0673282  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3948  para-aminobenzoate synthase component II  62.83 
 
 
191 aa  255  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3705  para-aminobenzoate synthase component II  62.83 
 
 
191 aa  255  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  62.83 
 
 
187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.83 
 
 
187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  62.83 
 
 
187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4583  para-aminobenzoate synthase component II  64.21 
 
 
191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  64.06 
 
 
192 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  62.83 
 
 
187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  62.83 
 
 
187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  62.83 
 
 
187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  62.63 
 
 
238 aa  252  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  62.3 
 
 
187 aa  251  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  62.3 
 
 
187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3855  para-aminobenzoate synthase component II  62.63 
 
 
191 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  62.96 
 
 
187 aa  251  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2729  para-aminobenzoate synthase component II  63.54 
 
 
192 aa  250  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0638  anthranilate synthase component II  63.54 
 
 
199 aa  250  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  61.78 
 
 
187 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60.21 
 
 
195 aa  248  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00080  para-aminobenzoate synthase component II  64.25 
 
 
195 aa  248  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3615  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.94 
 
 
194 aa  248  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5115  anthranilate synthase component II  62.18 
 
 
197 aa  247  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  62.05 
 
 
199 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60.21 
 
 
195 aa  246  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2321  anthranilate synthase, component II  61.14 
 
 
195 aa  246  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0251502  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.62 
 
 
197 aa  246  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  59.69 
 
 
195 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.58 
 
 
192 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46130  anthranilate synthase component II  62.56 
 
 
197 aa  245  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.64 
 
 
195 aa  245  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  59.16 
 
 
195 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  59.16 
 
 
195 aa  244  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  59.16 
 
 
195 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  62.5 
 
 
201 aa  244  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  62.5 
 
 
201 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0367  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.9 
 
 
192 aa  244  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0592  anthranilate synthase, component II  61.54 
 
 
199 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.64 
 
 
195 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.64 
 
 
195 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  61.46 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3946  anthranilate synthase component II  61.66 
 
 
198 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4783  anthranilate synthase component II  61.86 
 
 
197 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  60.21 
 
 
192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.38 
 
 
191 aa  242  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.12 
 
 
195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  60 
 
 
191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  60.32 
 
 
204 aa  240  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0420  anthranilate synthase component II  61.03 
 
 
197 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0538249  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0453  anthranilate synthase component II  61.03 
 
 
197 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  58.64 
 
 
187 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  61.03 
 
 
197 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  58.64 
 
 
187 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  61.46 
 
 
192 aa  239  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  58.64 
 
 
187 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  58.64 
 
 
187 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.64 
 
 
195 aa  238  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  58.12 
 
 
187 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.21 
 
 
200 aa  236  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  57.37 
 
 
192 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.81 
 
 
197 aa  236  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  60 
 
 
205 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  60 
 
 
195 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0653  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  53.14 
 
 
214 aa  235  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  57.89 
 
 
189 aa  234  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.04 
 
 
193 aa  234  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  58.73 
 
 
190 aa  234  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  59.38 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2495  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.99 
 
 
193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0786321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  56.77 
 
 
191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0549  Para-aminobenzoate synthase, glutamine amidotransferase component  60.94 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.481962  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.16 
 
 
188 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2801  anthranilate synthase component II  55.79 
 
 
202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  57.89 
 
 
190 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  58.95 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  56.84 
 
 
189 aa  231  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.47 
 
 
190 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  59.47 
 
 
190 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0752  anthranilate synthase, component II  56.77 
 
 
192 aa  230  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2585  anthranilate synthase component II  56.02 
 
 
195 aa  229  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  57.81 
 
 
190 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3179  anthranilate synthase component II  58.42 
 
 
189 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  56.77 
 
 
189 aa  228  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>