More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0653 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0653  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  100 
 
 
214 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  57.84 
 
 
204 aa  241  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3015  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  55.39 
 
 
216 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067902  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.83 
 
 
192 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50.98 
 
 
192 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  53.14 
 
 
190 aa  235  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0567  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.33 
 
 
194 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000013405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3758  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.33 
 
 
194 aa  234  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000630445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3884  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.33 
 
 
194 aa  234  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.012296  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0806  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  55.61 
 
 
197 aa  234  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000445998  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3701  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.33 
 
 
194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000872657  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  51.96 
 
 
189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0638  anthranilate synthase component II  52.91 
 
 
199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0613  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  53.14 
 
 
191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0607  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  52.88 
 
 
203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00205694  normal  0.186857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0606  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  53.37 
 
 
191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0575  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  53.14 
 
 
195 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267305  normal  0.552155 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  51.96 
 
 
189 aa  232  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3423  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  52.88 
 
 
196 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585956  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00080  para-aminobenzoate synthase component II  54.59 
 
 
195 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  50 
 
 
192 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2196  para-aminobenzoate synthase component II  54.59 
 
 
193 aa  231  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  48.6 
 
 
195 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  50 
 
 
195 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.53 
 
 
195 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.53 
 
 
195 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.53 
 
 
195 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.06 
 
 
195 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.53 
 
 
195 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0752  anthranilate synthase, component II  52.45 
 
 
192 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  52.94 
 
 
189 aa  228  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4583  para-aminobenzoate synthase component II  55.39 
 
 
191 aa  228  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  52.88 
 
 
201 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  51.96 
 
 
189 aa  228  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2801  anthranilate synthase component II  50.93 
 
 
202 aa  228  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0641  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.11 
 
 
192 aa  228  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  54.41 
 
 
187 aa  228  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  52.88 
 
 
190 aa  228  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.88 
 
 
190 aa  228  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00501  P-aminobenzoate synthetase, component II  54.41 
 
 
194 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0974  anthranilate synthase component II  53.43 
 
 
207 aa  227  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000708757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3855  para-aminobenzoate synthase component II  54.9 
 
 
191 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  54.41 
 
 
187 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.41 
 
 
187 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  54.41 
 
 
187 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.06 
 
 
195 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  50.48 
 
 
199 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  54.41 
 
 
187 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.06 
 
 
195 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  50.49 
 
 
195 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  54.41 
 
 
187 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  51.96 
 
 
190 aa  225  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  54.41 
 
 
187 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  51.72 
 
 
193 aa  225  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0367  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.71 
 
 
192 aa  225  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3948  para-aminobenzoate synthase component II  53.92 
 
 
191 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0244  para-aminobenzoate synthase component II  53.92 
 
 
191 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0673282  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3705  para-aminobenzoate synthase component II  53.92 
 
 
191 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  48.58 
 
 
195 aa  225  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  51.47 
 
 
191 aa  225  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0592  anthranilate synthase, component II  50.96 
 
 
199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0907  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50 
 
 
201 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000149415  hitchhiker  0.00000000332325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4160  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.11 
 
 
190 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  51.44 
 
 
201 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  54.41 
 
 
187 aa  224  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  54.41 
 
 
187 aa  224  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1441  anthranilate synthase component II  52.94 
 
 
207 aa  224  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.100747  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  49.51 
 
 
192 aa  224  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  53.92 
 
 
238 aa  224  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  53.92 
 
 
187 aa  224  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  49.76 
 
 
195 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  50.47 
 
 
197 aa  222  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  50 
 
 
191 aa  222  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  52.94 
 
 
187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2729  para-aminobenzoate synthase component II  51.94 
 
 
192 aa  221  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50.93 
 
 
200 aa  221  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.62 
 
 
197 aa  221  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  52.45 
 
 
187 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5115  anthranilate synthase component II  50 
 
 
197 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  52.45 
 
 
187 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50.98 
 
 
191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  49.05 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  52.45 
 
 
187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  52.45 
 
 
187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2037  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50.73 
 
 
225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.388628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3302  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.94 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4783  anthranilate synthase component II  49.05 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  51.96 
 
 
192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0101  anthranilate synthase component II  51.9 
 
 
201 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.134219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3615  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50.72 
 
 
194 aa  218  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  49.51 
 
 
188 aa  217  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  50 
 
 
189 aa  217  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0549  Para-aminobenzoate synthase, glutamine amidotransferase component  53.14 
 
 
196 aa  217  8.999999999999998e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.481962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0453  anthranilate synthase component II  48.57 
 
 
197 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46130  anthranilate synthase component II  49.04 
 
 
197 aa  216  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50 
 
 
197 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  48.54 
 
 
190 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  50 
 
 
205 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3124  anthranilate synthase component II  49.51 
 
 
189 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2048  anthranilate synthase component II  49.51 
 
 
187 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0195497  normal  0.263203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>