More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0613 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0613  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0607  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  95.81 
 
 		 203 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00205694  normal  0.186857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3423  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  95.81 
 
 		 196 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585956  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0606  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  94.24 
 
 		 191 aa  374  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3884  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  89.53 
 
 		 194 aa  360  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.012296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3758  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  89.53 
 
 		 194 aa  360  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000630445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0567  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  88.48 
 
 		 194 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000013405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3701  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  89.01 
 
 		 194 aa  358  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000872657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0641  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  87.37 
 
 		 192 aa  345  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0575  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  82.63 
 
 		 195 aa  330  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267305  normal  0.552155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4160  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  81.58 
 
 		 190 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0806  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  79.79 
 
 		 197 aa  324  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000445998  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  78.42 
 
 		 190 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3015  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  78.19 
 
 		 216 aa  318  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3519  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  80.85 
 
 		 190 aa  310  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3302  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  77.01 
 
 		 189 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3705  para-aminobenzoate synthase component II  68.06 
 
 		 191 aa  275  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0244  para-aminobenzoate synthase component II  68.06 
 
 		 191 aa  275  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0673282  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3948  para-aminobenzoate synthase component II  68.06 
 
 		 191 aa  275  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2196  para-aminobenzoate synthase component II  69.59 
 
 		 193 aa  268  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2729  para-aminobenzoate synthase component II  67.19 
 
 		 192 aa  267  8.999999999999999e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3855  para-aminobenzoate synthase component II  66.84 
 
 		 191 aa  266  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4583  para-aminobenzoate synthase component II  68.42 
 
 		 191 aa  266  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00080  para-aminobenzoate synthase component II  68.21 
 
 		 195 aa  266  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  66.67 
 
 		 238 aa  265  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  64.55 
 
 		 187 aa  256  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  64.55 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  64.55 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  64.55 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  64.55 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  64.55 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  64.55 
 
 		 187 aa  254  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.234421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  64.02 
 
 		 187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0367  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.96 
 
 		 192 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  63.16 
 
 		 192 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  64.02 
 
 		 187 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  64.02 
 
 		 187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  63.02 
 
 		 192 aa  251  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  62.3 
 
 		 187 aa  250  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  62.3 
 
 		 187 aa  250  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  62.3 
 
 		 187 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  62.3 
 
 		 187 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  64.77 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  61.78 
 
 		 187 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0638  anthranilate synthase component II  62.5 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.11 
 
 		 191 aa  247  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.9 
 
 		 193 aa  247  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5115  anthranilate synthase component II  62.18 
 
 		 197 aa  247  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  62.37 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  63.54 
 
 		 201 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.85 
 
 		 192 aa  245  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  61.66 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0592  anthranilate synthase, component II  61.34 
 
 		 199 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747776  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  60.1 
 
 		 197 aa  243  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  61.98 
 
 		 192 aa  243  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4783  anthranilate synthase component II  61.66 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.95 
 
 		 192 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2321  anthranilate synthase, component II  63.54 
 
 		 195 aa  242  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0251502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3615  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.94 
 
 		 194 aa  241  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  61.38 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3946  anthranilate synthase component II  60.62 
 
 		 198 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  59.9 
 
 		 189 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46130  anthranilate synthase component II  61.34 
 
 		 197 aa  241  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  59.9 
 
 		 205 aa  240  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  60.53 
 
 		 204 aa  240  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  59.16 
 
 		 195 aa  240  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  59.16 
 
 		 195 aa  240  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0368  anthranilate synthase component II  60.53 
 
 		 190 aa  240  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.64 
 
 		 195 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  60.62 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  60.21 
 
 		 190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0420  anthranilate synthase component II  60.1 
 
 		 197 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0538249  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0453  anthranilate synthase component II  60.1 
 
 		 197 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.64 
 
 		 195 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  59.16 
 
 		 189 aa  237  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4455  anthranilate synthase component II  60.53 
 
 		 190 aa  237  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.12 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.12 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  58.12 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  59.38 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  60.85 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  58.73 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  57.59 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  57.81 
 
 		 189 aa  235  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  59.9 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  59.47 
 
 		 188 aa  236  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0549  Para-aminobenzoate synthase, glutamine amidotransferase component  60.1 
 
 		 196 aa  235  2e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.481962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  58.33 
 
 		 189 aa  234  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  57.29 
 
 		 189 aa  234  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  60.32 
 
 		 188 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  57.59 
 
 		 195 aa  234  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.99 
 
 		 197 aa  234  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3124  anthranilate synthase component II  58.64 
 
 		 189 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680889 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.03 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.33 
 
 		 197 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3179  anthranilate synthase component II  58.95 
 
 		 189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0653  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  53.14 
 
 		 214 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  57.29 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  57.07 
 
 		 195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2759  anthranilate synthase component II  58.12 
 
 		 189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>