More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  100 
 
 		 248 aa  480  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  50 
 
 		 275 aa  206  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  53.85 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  52.52 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  40.5 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  39.27 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  44 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  40.2 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  43.07 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  42.08 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  37.76 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  36.29 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  38.69 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  37.76 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  38.05 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  34.89 
 
 		 228 aa  99  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  38.19 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  34.85 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  34.83 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  35.61 
 
 		 947 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.47 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  38.01 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  31.47 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  34.83 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  29.44 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  35.59 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  32.22 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.94 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.94 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  39.52 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  31.19 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  40.52 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  39.2 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  32.57 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  37.57 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  25.91 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  36.95 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  35.8 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  38.61 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  38.61 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  38.61 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  38.61 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  38.61 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  34.39 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  26.79 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  38.61 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  38.61 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  32.45 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  34.63 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  35.19 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  32.51 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  36 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  30.93 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  31.78 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  28.33 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  36.46 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  27.5 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  40.51 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  28.38 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  34.95 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  26.44 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  28.74 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  26.37 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  35.5 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  30.5 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  33.19 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  28.06 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  32.43 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  37.06 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  34.45 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.55 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  32.47 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  34.58 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  32.86 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  38.12 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  37.11 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  36.5 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  34.98 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  25.55 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  25.55 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  32.5 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  36.14 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  35.64 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  35.62 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  34.46 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  30.36 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  35.64 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  28.63 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  30.52 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  35.64 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  30.41 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  39.74 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  33.03 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  36.42 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>