More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3336 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  87.45 
 
 		 255 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  50.21 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  44.62 
 
 		 242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  43.75 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4908  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  41.77 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  40.08 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  39.32 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  39.57 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  37.61 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  35.75 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  41.21 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  34.47 
 
 		 232 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  38.22 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  35.53 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  38.62 
 
 		 231 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  35.94 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  34.54 
 
 		 288 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.64 
 
 		 229 aa  95.9  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  35.86 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  35.29 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  35.45 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  29.38 
 
 		 243 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  35.35 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  35.59 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  31.71 
 
 		 238 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  34.67 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  40.25 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  33.85 
 
 		 248 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  35.47 
 
 		 238 aa  89  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  39.84 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  35.86 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  35.48 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  38.31 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  33.17 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  31.75 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  31.25 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  32.67 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  31.41 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  36.71 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  31.22 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  31.52 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  28.51 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  31 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  36.46 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  30.21 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  43.57 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  30.14 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  30.94 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  35.75 
 
 		 947 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  34.05 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  29.02 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  31.43 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  32.32 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  39.04 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  31.94 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  31.94 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  28.03 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  34.15 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  34.48 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  40.83 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  32.18 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  34.75 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  35.45 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  32.32 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  33.17 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  41.09 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  31.44 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  37.06 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  32.83 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  34.33 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  35.03 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  35.56 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  27.49 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  31.3 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  31.58 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  32.35 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  30.93 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  34.07 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  32.82 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  28.27 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  32.56 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>