More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0273 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  77.18 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  75.1 
 
 		 265 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  73.9 
 
 		 267 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  65.37 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  65.37 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  64.94 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  60.33 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  58.72 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  58.23 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  58.44 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  55.84 
 
 		 242 aa  271  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  54.69 
 
 		 288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  57.5 
 
 		 254 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  56.07 
 
 		 261 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  53.61 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  42.86 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  40.11 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  38.62 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  35.24 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  29.39 
 
 		 229 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  32.49 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  32.49 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  34.78 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  38.1 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.03 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.03 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  36.68 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  32.44 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  32.63 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  34.74 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  35.11 
 
 		 229 aa  102  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  34.93 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  34.16 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  35.68 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  36.31 
 
 		 231 aa  95.9  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  34.39 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  31.63 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  40.65 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  32.35 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  31.91 
 
 		 233 aa  92.8  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 224 aa  92.8  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36.25 
 
 		 238 aa  92  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  31.61 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  36.61 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  31.47 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  36.61 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  36.62 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  32.07 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  36.61 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  34.22 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  36.61 
 
 		 239 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  36.61 
 
 		 239 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  41.13 
 
 		 232 aa  89  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.69 
 
 		 209 aa  88.6  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  34.83 
 
 		 241 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  36.46 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  33.01 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  31.6 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  32.31 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  34.59 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  37.2 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  32.47 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  37.57 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  36.61 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.93 
 
 		 224 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  30.85 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  36.5 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  33.19 
 
 		 237 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 244 aa  85.9  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  28.51 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  36.07 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  32.32 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  33.75 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  31.07 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  33.62 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  35.62 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  32.58 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  32.18 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  31.41 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  32.07 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  35.16 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  36.9 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  32.85 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  33.84 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  34.25 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  28.81 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  28.93 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.31 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  33.71 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  34.9 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  34.05 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>