More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1012 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  100 
 
 
249 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  97.59 
 
 
249 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  86.01 
 
 
244 aa  427  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  64.94 
 
 
269 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  61.6 
 
 
265 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  62.55 
 
 
267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  63.36 
 
 
260 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  55.17 
 
 
248 aa  268  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  55.93 
 
 
259 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  57.02 
 
 
251 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  56.77 
 
 
254 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  56.14 
 
 
251 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  54.82 
 
 
242 aa  254  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  57.27 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  53.98 
 
 
261 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  52.67 
 
 
261 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  42.74 
 
 
255 aa  186  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  33.19 
 
 
231 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  33.04 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  36.68 
 
 
252 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  37.04 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  34.62 
 
 
237 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 
237 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  30.46 
 
 
243 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  33.91 
 
 
239 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  35.03 
 
 
247 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  32.64 
 
 
227 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  35.47 
 
 
231 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  29.81 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  38.67 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  28.7 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  34.63 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  37.17 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  28.4 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  30.6 
 
 
228 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  33.9 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  34.87 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  32.63 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  40.51 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.41 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  32.76 
 
 
237 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  35.11 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  32.49 
 
 
236 aa  92.8  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  33.03 
 
 
218 aa  92.8  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
227 aa  92.4  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  32.8 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  29.15 
 
 
232 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
227 aa  92.4  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  30.25 
 
 
232 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  33.19 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  31.28 
 
 
236 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  32.66 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  34.47 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
231 aa  89  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  33.49 
 
 
235 aa  88.6  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  34.03 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  29.55 
 
 
228 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  27.85 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  31.44 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  35.83 
 
 
234 aa  85.1  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  36.06 
 
 
234 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  34.27 
 
 
236 aa  85.1  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  30.28 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  33.13 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  36.07 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  29.13 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  29.13 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  32.56 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  29.13 
 
 
239 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  33.9 
 
 
232 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  31.49 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  29.46 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  31.86 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  34.09 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  29.5 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  28.17 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  29.13 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.14 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  29.13 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  25 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  34.9 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  32.98 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  36.27 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  32.6 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  30.53 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  32.08 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  29.55 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  34.98 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  31.35 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  31.07 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  29.33 
 
 
282 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  35.71 
 
 
234 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  25.42 
 
 
240 aa  79  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  31.02 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  33.87 
 
 
389 aa  78.6  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  30.48 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>