283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3054 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 231 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  36.65 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  37.72 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  34.39 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  35.09 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  33.48 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  36.32 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  34.06 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  33.19 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  35.24 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  33.77 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  35.24 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  35.71 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29.74 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  35.56 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  35.57 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  32.52 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  37.8 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  35.36 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  35.36 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  33.04 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  34.06 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  37.17 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 		 236 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  40.6 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  34.39 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  33.54 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  36.57 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  33.74 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  31.73 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  31.73 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  36.22 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  32.09 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  39.53 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  35.08 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  38.85 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  39.86 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  25.93 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  31.35 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  33.13 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  38.41 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  40.4 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  39.1 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  33.69 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  31.94 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  37.41 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  31.8 
 
 		 389 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  38.41 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  36.14 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  31.55 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  31.69 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  30.34 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  38.52 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  35.14 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  31.63 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  36.54 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  33.51 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  37.27 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  35.26 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  30.61 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  31.4 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  29.73 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  35.71 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  31.62 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  26.27 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  32.39 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  32.42 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  30.27 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  31.58 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  29.9 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  31.44 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  33.77 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  33.77 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  33.77 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  33.77 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  33.77 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  32.22 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  38.1 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  36.13 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  30.65 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  31.21 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  33.11 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>