More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3704 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  100 
 
 
251 aa  517  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  93.63 
 
 
251 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  75.45 
 
 
254 aa  359  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  68.28 
 
 
261 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  66.67 
 
 
248 aa  335  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  58.72 
 
 
269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  55.17 
 
 
265 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  56.14 
 
 
249 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  56.14 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  55.41 
 
 
260 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  55.17 
 
 
267 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  56.19 
 
 
244 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  53.15 
 
 
288 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  53.85 
 
 
261 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  48.37 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  50 
 
 
259 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  48.78 
 
 
242 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 
236 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  41.27 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  33.48 
 
 
231 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  38.04 
 
 
220 aa  111  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  30.63 
 
 
229 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  34.59 
 
 
227 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  36.51 
 
 
246 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  34.59 
 
 
227 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  32.24 
 
 
232 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  33.02 
 
 
252 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  34.22 
 
 
231 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  35.87 
 
 
227 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  32.45 
 
 
237 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  32.45 
 
 
237 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  36.52 
 
 
236 aa  99  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  31.91 
 
 
230 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  31.64 
 
 
226 aa  98.6  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  35.11 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 
231 aa  95.9  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  31.79 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  29.61 
 
 
228 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  32.29 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  36.09 
 
 
231 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  32.57 
 
 
218 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  31.11 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  31.28 
 
 
243 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  31.47 
 
 
234 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  37.93 
 
 
244 aa  92  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  31.53 
 
 
245 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  30.32 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  34.29 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  32.98 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  28.34 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  38.3 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  35.23 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  35.5 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  39.72 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  36.17 
 
 
232 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.87 
 
 
233 aa  89  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  33.03 
 
 
224 aa  88.6  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  28.63 
 
 
245 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  34.36 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  35.79 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  28.51 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  35.64 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  36.47 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 
228 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  40 
 
 
239 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  34.21 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  28.51 
 
 
243 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 
237 aa  86.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  32.51 
 
 
264 aa  85.1  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  31.66 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  30.04 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.77 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  29.41 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  32.22 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  26.52 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  38.57 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  32.28 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  33.91 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  32.02 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  35.34 
 
 
229 aa  82  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  34.65 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  36.55 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  31.07 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.72 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  35.09 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  29.47 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  30.96 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  33.57 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  29.95 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  34.03 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>