More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3397 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 246 aa  483  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  53.33 
 
 		 261 aa  228  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  49.78 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  49.34 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  46.31 
 
 		 242 aa  175  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  39.35 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  39.41 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  40.08 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  40.97 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  37.73 
 
 		 233 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  40.55 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 		 275 aa  118  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  41.15 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  38.34 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  38.14 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  37.89 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  40.51 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  33.49 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  41.18 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  38.42 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  28.17 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  38.12 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  35.54 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  41.27 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  36.51 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  34.91 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  34.91 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  36.13 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  34.66 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  37.37 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  38.18 
 
 		 220 aa  105  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  34.98 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  39.36 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  35.14 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  35.71 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4908  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  36.04 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  32.37 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  37.37 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  32.37 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  34.48 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  38.69 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  42.46 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  35.94 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  37.44 
 
 		 947 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  40.26 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  43.36 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  36.46 
 
 		 230 aa  98.6  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  32.46 
 
 		 227 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  32.46 
 
 		 227 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  36.73 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  33.91 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  37.27 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  37.93 
 
 		 236 aa  95.9  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  35.15 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  40.88 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  36.14 
 
 		 247 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  36.63 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.37 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  35.94 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  32.67 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  27.97 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  34.65 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  34.48 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  35.79 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 237 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  34.43 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  31.47 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  36.87 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  34.5 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  35.94 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  39.74 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  29.44 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  35.88 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 		 247 aa  88.6  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  33.18 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  35.17 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  33.04 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  34.52 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  31.05 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  30.27 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  33.68 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  33.15 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  36.36 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  35.35 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  40.69 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  34.21 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  36.13 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  43.33 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  37.64 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  36.13 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  29.62 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>